MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2558865271 · doi:10.1080/19336896.2016.1254857

Role of polysaccharide and lipid in lipopolysaccharide induced prion protein conversion

2016· article· en· W2558865271 sur OpenAlexafffund
Carol L. Ladner-Keay, Marcia LeVatte, David S. Wishart

Notice bibliographique

RevuePrion · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Prion Research InstituteDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésLipid ACircular dichroismLipopolysaccharideChemistryRecombinant DNABiochemistryConformational changePolysaccharideProteinase KScrapieBiophysicsBiologyEnzymePrion proteinImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Conversion of native cellular prion protein (PrPc) from an α-helical structure to a toxic and infectious β-sheet structure (PrPSc) is a critical step in the development of prion disease. There are some indications that the formation of PrPSc is preceded by a β-sheet rich PrP (PrPβ) form which is non-infectious, but is an intermediate in the formation of infectious PrPSc. Furthermore the presence of lipid cofactors is thought to be critical in the formation of both intermediate-PrPβ and lethal, infectious PrPSc. We previously discovered that the endotoxin, lipopolysaccharide (LPS), interacts with recombinant PrPc and induces rapid conformational change to a β-sheet rich structure. This LPS induced PrPβ structure exhibits PrPSc-like features including proteinase K (PK) resistance and the capacity to form large oligomers and rod-like fibrils. LPS is a large, complex molecule with lipid, polysaccharide, 2-keto-3-deoxyoctonate (Kdo) and glucosamine components. To learn more about which LPS chemical constituents are critical for binding PrPc and inducing β-sheet conversion we systematically investigated which chemical components of LPS either bind or induce PrP conversion to PrPβ. We analyzed this PrP conversion using resolution enhanced native acidic gel electrophoresis (RENAGE), tryptophan fluorescence, circular dichroism, electron microscopy and PK resistance. Our results indicate that a minimal version of LPS (called detoxified and partially de-acylated LPS or dLPS) containing a portion of the polysaccharide and a portion of the lipid component is sufficient for PrP conversion. Lipid components, alone, and saccharide components, alone, are insufficient for conversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePrionMême sujetPrion Diseases and Protein MisfoldingTravaux en français237 207