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Enregistrement W2559001170 · doi:10.1093/ofid/ofw194.74

The Burden of Pneumococcal Community-Acquired Pneumonia and Invasive Pneumococcal Disease in Hospitalized Adults: A Canadian Immunization Research Network (CIRN) Serious Outcomes Surveillance (SOS) Network Study

2016· article· en· W2559001170 sur OpenAlexaffabout
Jason J. LeBlanc, May ElSherif, Donna MacKinnon‐Cameron, Lingyun Ye, Ardith Ambrose, Irene Martín, Haley Gillis, Amanda Lang, Melissa K. Andrew, Guy Boivin, William Bowie, Karen Green, Todd F. Hatchette, Jennie Johnstone, Mark Loeb, Anne McCarthy, Allison McGeer, Sanela Moraca, Makeda Semret, Grant Stiver, Sylvie Trottier, Louis Valiquette, Duncan Webster, Shelly McNeil

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de SherbrookeMcMaster UniversityMount Sinai HospitalHorizon Health NetworkUniversity of British ColumbiaOttawa HospitalIzaak Walton Killam Health CentreCentre hospitalier universitaire de QuébecNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesPfizer
Mots-clésMedicinePneumococcal diseasePneumoniaCommunity-acquired pneumoniaImmunizationStreptococcus pneumoniaePneumococcal pneumoniaIntensive care medicineDiseaseImmunologyAntibioticsInternal medicineAntibodyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Pneumococcal community acquired pneumonia (CAP) and invasive pneumococcal disease (IPD) cause significant morbidity and mortality worldwide. Although childhood immunization programs have reduced the burden of pneumococcal disease, there is insufficient data in Canada to advise immunization policy in adults. This study aimed to describe clinical outcomes of pneumococcal CAP and IPD in hospitalized Canadian adults, and determine the proportion of patients with vaccine-preventable disease. Methods. To establish the burden of pneumococcal disease, active surveillance for CAP and IPD in hospitalized adults was performed in five Canadian provinces from December 2010 to 2013. The serotype distribution was characterized using the Quellung reaction, PCR-based serotyping, and urine antigen detection (UAD). Results. Of 4769 cases of all-cause CAP, a laboratory test for pneumococci was performed in 3703. Of these, 516 (13.9%) were pneumococcal CAP (CAPSpn) and 238 (6.4%) were bacteremic CAPSpn. In addition to CAP, 80 cases of IPD (non-CAP) were identified. The burden of CAPSpn, bacteremic CAPSpn, and IPD was evident in terms of intensive care unit admission, mechanical ventilation, and 30-day mortality. Overall, the proportion of all-cause CAP with laboratory testing identifying a 13-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV13) or 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine (PPV23) serotype was 6.2% and 7.1%, respectively. However, these values are underestimated; 41.9% of the CAPSpn case isolates were not viable upon re-culturing, non-typeable, or unavailable for serotyping. Of the available serotypes, PCV13- and PPV23-serotypes represented 76.0% and 87.7% in CAPSpn, respectively. If these proportions are extrapolated to the overall contribution of CAPSpn to all-cause CAP of 13.9%, PCV13- and PPV23-serotypes would represent 10.6% and 12.2% of all-cause CAP, respectively. The results of a PCV13-specific UAD were consistent with this estimation at 197/1907 (10.3%). Conclusion. This study demonstrated that pneumococcal CAP and IPD are significant causes of morbidity and mortality in hospitalized Canadian adults, with a large proportion of available S. pneumoniae serotypes being vaccine-preventable. Disclosures. M. K. Andrew, GSK: Investigator, Research support; G. Boivin, Biocryst: Investigator, Research grant. Merck: Investigator, Research grant; W. Bowie, GSK: Investigato, Research grant; T. Hatchette, GSK: Investigator, Research grant; M. Loeb, GSK: Investigator, Research support; A. E. McCarthy, GSK: Investigator, Research support; S. A. McNeil, GSK: Grant Investigator, Research grant and Research support. Pfizer: Grant Investigator, Consulting fee, Research grant, Research support and Speaker honorarium. Merck: Consultant and Investigator, Consulting fee, Research support and Speaker honorarium

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,206
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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