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Enregistrement W2559113288 · doi:10.1107/s2053273314083569

Structural and biophysical characterization of human RNase 6

2014· article· en· W2559113288 sur OpenAlexaff
Donald Gagné, Jean‐François Couture, Miljan Simonović, Nicolas Doucet

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity of OttawaInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNase PRNABiologyStructural motifBiochemistryFunction (biology)EnzymeRNase HRNase MRPRibonucleaseSUPERFAMILYConserved sequenceComputational biologyGeneticsChemistryPeptide sequenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human members of the RNase A superfamily include eight rapidly evolving homologous enzymes with varying ribonucleolytic activity. All eight canonical members are characterized by the presence of two histidines and a lysine forming the catalytic triad, in addition to strictly conserved cysteines involved in the formation of 3 or 4 disulfide bridges essential for structural integrity. Despite these architectural and catalytic similarities, human RNases are functionally diverse and their biological activities remain elusive. Apart from degrading RNA with varying degrees of efficiency, these structural homologues have acquired a variety of distinct biological functions, including anti-bactericidal, cytotoxic, angiogenic, immunosuppressive, anti-tumoral and/or anti-viral activities. Among human members of this vertebrate-specific family, RNase 6 and RNase 8 have never been structurally resolved. To better understand its biological function and to characterize its molecular interactions with RNA and/or potential unknown ligands, we present the three-dimensional structure of human RNase 6 in its apo form. While the enzyme shares similar structural features with other members of the RNase A superfamily, we emphasize interesting differences unique to RNase 6 that may be pertaining to its unique biological function. Additional NMR, CD and ITC biophysical characterization in presence of RNA ligands will also be presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,418
Score d'incertitude au seuil0,302

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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