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Enregistrement W2559182734 · doi:10.1107/s2053273314092985

Analysis of bacterial cell-wall synthesis to combat antibiotic resistance

2014· article· en· W2559182734 sur OpenAlexaff
Dustin T. King, N.C.J. Strynadka

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeptidoglycanPeriplasmic spaceGlycanBacterial cell structureAntibioticsMicrobiologyEnzymeCell wallAntibiotic resistancePenicillin binding proteinsBacteriaBiochemistryBiologyLipid IIBacterial outer membraneGlycosyltransferaseChemistryPenicillinEscherichia coliGeneGeneticsGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The peptidoglycan biosynthetic pathway is one of the most important processes in the bacterial cell to be exploited as a target for the design of antimicrobial drugs to combat infection and pathogenesis. This pathway, unique to bacteria, utilizes over twenty enzymes, likely in concert, with reactions that proceed from the cytoplasm, across the membrane and into the periplasmic space culminating in the production of the mesh-like structure composed of polymerized glycan and cross-linked peptide components that form the major structural component of the essential bacterial protective barrier known as the cell wall. Work in our group has aimed at understanding the structural and kinetic properties of several of these enzymes including the glycosyltransferase/transpeptidase activity of a family of enzymes known historically as the penicillin binding proteins (PBPs). As the name implies, these enzymes are also the target of beta-lactam antibiotics, and molecular modifications to transpeptidase variants have been shown to be linked to increased antibiotic resistance in superbugs such as Methicillin Resistant Staphlococcal aureus (MRSA). In parallel, highly disseminated plasmid-encoded beta-lactamase enzymes, with structural and mechanistic ties to the transpeptidases, have also arisen in many of the clinically important bacterial pathogens, leading to further widespread beta-lactam antibiotic resistance. The molecular details of these critical enzymatic reactions in bacterial viability and drug resistance will be presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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