The organomercurial lyase Merb possesses unique metal-binding properties
Notice bibliographique
Résumé
Select bacterial strains survive in mercury-contaminated environments due to acquisition of a transferable genetic element known as the mer operon. The mer operon typically encodes for a series of proteins that includes two enzymes, MerA and MerB. The organomercurial lyase (MerB) cleaves carbon-mercury bonds of organomercurial compounds yielding ionic mercury Hg (II) and a reduced-carbon compound. The Hg (II) ion product remains bounds until it is shuttled directly to the mercuric ion reductase (MerA) to be reduced. Based on NMR spectroscopy and X-ray crystallography studies1, we have determined that Cys96, Asp99 and Cys159 of E. Coli MerB form a catalytic triad required for cleavage of the carbon-Hg bond and binding of the Hg (II) ion product. The three catalytic residues are conserved in 61 of 65 known variants of MerB and the four remaining variants retain both cysteine residues, but contain a serine in place of Asp99. Given its unique activity, we have examined the role of serine as a catalytic residue and the ability of MerB to cleave other organometals such as organotin (known substrates or inhibitors) and organolead compounds. Soaking MerB crystals with either dimethyltindibromide or trimethylleadchloride compound indicates that MerB crystals have the capacity to cleave both carbon-Sn and carbon-Pb bonds, and we have determined crystal structures of a MerB-Sn and a MerB-Pb complex. Furthermore, substitution of Ser for Asp99 (MerB D99S) in E. coli MerB alters the metal-binding specificity, as MerB D99S chelated an unknown metal during its purification. X-ray crystallography, ICP-MS and electron paramagnetic resonance (EPR) studies were performed to identify the unknown metal and the results of these studies will be presented. Given that mercury contaminated sites are often contaminated with other heavy metals, these studies indicate that other heavy metals may have important implications when using MerA and MerB in bioremediation of organomercurial compounds.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».