Structural Study of Thioesterase Domains in Complex with Covalent Inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
Polyketide synthases (PKS) are large multifunctional enzymes that are responsible for the biosynthesis of a wide array of secondary metabolites that are of great interest for medical applications. PKS catalyze carbon-carbon bond formations by successive Claisen condensations of small thioesters. All PKS are organized in modules where each module is composed of catalytic domains that add a single ketide unit to the growing chain and optionally reduce the beta-keto function. The Thioesterase (TE) domain is responsible for the released of the final polyketide chain. Two ways are used by the TE domains: hydrolysis to form a linear chain or cyclization to form a macrolide. The molecular mechanism which controls the cyclization versus hydrolysis decision is not fully understood and a better understanding of this mechanism could be a great interest for generating new pharmaceutical compounds. To answer this question, we are studying the structure and function of PKS TE domains in collaboration with the group of Dr. Boddy (University of Ottawa). Recent results about the biochemical study in complex with inhibitors, crystallization and structures of one of these TE domains will be presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».