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Enregistrement W2559698750 · doi:10.1182/blood.v108.11.1404.1404

Identification of Meis1 Target Genes Involved in the Induction of AML in Collaboration with NUP98-HOXD13.

2006· article· en· W2559698750 sur OpenAlexaff
Lars Palmqvist, Bob Argiropoulos, R. Keith Humphries

Notice bibliographique

RevueBlood · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHox geneBiologyHomeoboxCancer researchDownregulation and upregulationTranscription factorLeukemiaMolecular biologyCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Meis1, a homeodomain-containing HOX cofactor, cooperates with multiple native and NUP98-HOX fusion proteins to accelerate the onset of AML. We have recently shown that enforced overexpression of Meis1 in NUP98-HOX transduced bone marrow (bm) cells leads to a marked elevation in the tyrosine receptor molecule, Flt3 transcription and subsequent activation of Flt3 signaling pathways (Blood. Aug 1, 2006). Furthermore, overexpression of wildtype Flt3 is sufficient to collaborate with NUP98-HOX fusions to induce AML in mice, albeit with a longer disease latency than NUP98-HOX+Meis1-mediated AML. To further study the molecular mechanisms underlying Meis1’s strong pro-leukemic effect together with HOX proteins, we conducted a structure-function analysis of Meis1 in the context of NUP98-HOXD13 (ND13) leukemogenesis. We show that the homeodomain (ΔHD, amino acids 272–335) is required for Meis1 collaboration with ND13 while the N-terminal domain (ΔN, amino acids 1–67) is dispensable for leukemogenesis but decelerates the disease onset. Interestingly, primary bm cells transduced with ND13-Meis1ΔHD or ND13-Meis1ΔN revealed no significant upregulation of Flt3 mRNA levels in either case. These results suggest that Meis1 triggers additional Flt3-independent pathways to accelerate leukemia development. Thus, the retained leukemogenic properties of ND13-Meis1ΔN and the longer latency observed for NUP98-HOX fusions and Flt3 overexpression to induce leukemia point to additional roles for Meis1 in induction of leukemia independent of its ability to upregulate Flt3. To search for these additional Meis1-induced leukemic pathway(s), we used the Affymetrix GeneChip MOE430 to compare the gene expression profiles of bm cells transduced with ND13, ND13+Meis1, ND13+Meis1ΔHD and Meis1ΔN. Interestingly, the gene array results indicate that only a relatively small number of genes (72 increased and 64 decreased) differed significantly between the non-leukemic Meis1ΔHD and the leukemic Meis1 bm cells and these genes are all strong candidates as to be direct Meis1 target genes. A significant number of these genes are involved in cytokine receptor pathways as revealed by gene ontology analysis and, furthermore, promoter analysis revealed the presence of putative Hox, Meis1 and Pbx binding sites in several of these. The gene array results also indicate that only a small fraction of genes differed significantly between the non-leukemic Meis1ΔHD and the leukemic Meis1ΔN bm cells suggesting that these genes could be involved in Flt3-independent Meis1 leukemogenic activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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