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Enregistrement W2560110451 · doi:10.4236/fns.2016.714121

Extraction and Solubilization Methods Suitable for Proteomic Analysis of Common Bean Seed of Ivory Coast

2016· article· en· W2560110451 sur OpenAlexaff
Louise Ocho-Anin Atchibri, Etienne Dako, Benoît Sarazin

Notice bibliographique

RevueFood and Nutrition Sciences · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProteins in Food Systems
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryChromatographyPhaseolusExtraction (chemistry)UreaTrichloroacetic acidThioureaPolyacrylamide gel electrophoresisMass spectrometryProtein purificationSolubilizationGel electrophoresisBiochemistryBotanyBiologyEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extraction and solubilization of proteins from seeds of Phaseolus vulgarisms for two-dimension polyacrylamide gel electrophoresis (2D-PAGE) and analysis by mass spectrometry are very sensitive procedures. In this study, we used two methods of extraction and solubilization of proteins, the urea/thiourea method and the trichloroacetic acid (TCA)/acetone precipitation method, in order to determine their effectiveness in separating proteins from bean seeds by 2D-PAGE. In both methods, proteins were well separated by 2D PAGE with minor variations in the protein pattern. These two extraction methods showed that it was possible to separate hundreds of very resolvent proteins by 2D electrophoresis. A protein spot was selected on the 2D-PAGE gel, digested with trypsin and analyzed by mass spectrometry (LCMS/ MS). The results suggest that thiourea/urea and TCA methods were effective and reliable for the extraction and solubilization for 2D analysis of proteins from seeds of Phaseolus vulgaris .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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