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Enregistrement W2560318205 · doi:10.1016/j.biopsych.2016.11.013

An Analysis of Two Genome-wide Association Meta-analyses Identifies a New Locus for Broad Depression Phenotype

2016· review· en· W2560318205 sur OpenAlexaff
Neşe Direk, Stephanie Williams, Jennifer A. Smith, Stephan Ripke, Tracy Air, Azmeraw T. Amare, Najaf Amin, Bernhard T. Baune, David A. Bennett, Douglas Blackwood, Dorret I. Boomsma, Gerome Breen, Henriette N. Buttenschøn, Enda M. Byrne, Anders D. Børglum, Enrique Castelao, Sven Cichon, Toni‐Kim Clarke, Marilyn C. Cornelis, Udo Dannlowski, Philip L. De Jager, Ayşe Demirkan, Enrico Domenici, Cornelia M. van Duijn, Erin C. Dunn, Johan G. Eriksson, Tõnu Esko, Jessica D. Faul, Luigi Ferrucci, Myriam Fornage, Eco J. C. de Geus, Michael Gill, Scott D. Gordon, Hans J. Grabe, Gerard van Grootheest, Steven P. Hamilton, Catharina A. Hartman, Andrew C. Heath, Karin Hek, Albert Hofman, Georg Homuth, Carsten Horn, Sharon L. R. Kardia, Stefan Kloiber, Karestan C. Koenen, Zoltán Kutalik, Karl-Heinz Ladwig, Jari Lahti, Douglas F. Levinson, Cathryn M. Lewis, Glyn Lewis, Qingqin S. Li, David J. Llewellyn, Susanne Lucae, Kathryn L. Lunetta, Donald J. MacIntyre, Pamela Madden, Nicholas G. Martin, Andrew M. McIntosh, Andres Metspalu, Yuri Milaneschi, Grant W. Montgomery, Ole Mors, Thomas H. Mosley, Joanne M. Murabito, Bertram Müller‐Myhsok, Markus M. Nöthen, Dale R. Nyholt, Michael O‘Donovan, Brenda W.J.H. Penninx, Michele L. Pergadia, Roy H. Perlis, James B. Potash, Martin Preisig, Shaun Purcell, Jorge A. Quiroz, Katri Räikkönen, John P. Rice, Marcella Rietschel, Margarita Rivera, Thomas G. Schulze, Jianxin Shi, Stanley I. Shyn, Grant Sinnamon, Johannes H. Smit, Jordan W. Smoller, Harold Snieder, Toshiko Tanaka, Katherine E. Tansey, Alexander Teumer, Rudolf Uher, Daniel Umbricht, Sandra Van der Auwera, Erin B. Ware, David R. Weir, Myrna M. Weissman, Gonneke Willemsen, Jingyun Yang, Wei Zhao, Henning Tiemeier, Patrick F. Sullivan

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of King's College
Organismes subventionnairesEuropean Social FundNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilChinese Society of Clinical OncologyNational Institute on AgingDr Mortimer and Theresa Sackler FoundationNorwegian Biodiversity Information CentreLundbeckfondenNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsEuropean CommissionJohns Hopkins UniversityEuropean Science FoundationNational Science FoundationUniversity of WashingtonVrije Universiteit AmsterdamNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustGlaxoSmithKline
Mots-clésGenome-wide association studyMeta-analysisBiologyPhenotypeGeneticsLocus (genetics)Computational biologyGenetic associationDepression (economics)MedicineGenotypeGeneSingle-nucleotide polymorphismInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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