Biotyping of Arcobacter butzleri isolated from poultry products: rescuing a phenotypic method
Notice bibliographique
Résumé
Arcobacter butzleri is an emergent zoonotic foodborne pathogen associated to enteritis and occasionally to bacteremia in human beings. Biotyping of this bacterium is important in order to establish the circulating strains and its dissemination routes. The purpose of this work was to determine the circulating A. butzleri biotypes in poultry products for human consumption in Southern Chile using the method proposed by Lior and Woodward, in order to explore the possibility of introducing this biotyping scheme as a routine laboratory tool. From the 60 strains studied the prevalent biotypes were 8A, 8B, 7A, 4A and 4B. The most frequently isolated biotype, independently of the sample of origin, was 8A with (44 strains, 73.3%). The less frequently isolated biotype was 4B (two strains 3.3%). The biotyping method used results to be simple, easy to handle and yields stable results. Therefore, it might be rescued to be used as a phenotypic tool for epidemiological marking of A. butzleri.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».