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Enregistrement W2560641415 · doi:10.1016/j.jmb.2016.12.006

Systematic Identification of Oncogenic EGFR Interaction Partners

2016· article· en· W2560641415 sur OpenAlexaff
Julia Petschnigg, Max Kotlyar, Louise Blair, Igor Jurišica, Igor Štagljar, Robin Ketteler

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésEpidermal growth factor receptorCyclin-dependent kinase 8ERBB3Signal transductionBiologySmall hairpin RNACell biologyReceptor tyrosine kinaseProtein kinase BTyrosine kinaseGene knockdownCancer researchEpidermal growth factorReceptorCell cultureBiochemistryGeneticsNotch signaling pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The epidermal growth factor receptor (EGFR) is a receptor tyrosine kinase (TK) that-once activated upon ligand binding-leads to receptor dimerization, recruitment of protein complexes, and activation of multiple signaling cascades. The EGFR is frequently overexpressed or mutated in various cancers leading to aberrant signaling and tumor growth. Hence, identification of interaction partners that bind to mutated EGFR can help identify novel targets for drug discovery. Here, we used a systematic approach to identify novel proteins that are involved in cancerous EGFR signaling. Using a combination of high-content imaging and a mammalian membrane two-hybrid protein-protein interaction method, we identified eight novel interaction partners of EGFR, of which half strongly interacted with oncogenic, hyperactive EGFR variants. One of these, transforming acidic coiled-coil proteins (TACC) 3, stabilizes EGFR on the cell surface, which results in an increase in downstream signaling via the mitogen-activated protein kinase and AKT pathway. Depletion of TACC3 from cells using small hairpin RNA (shRNA) knockdown or small-molecule targeting reduced mitogenic signaling in non-small cell lung cancer cell lines, suggesting that targeting TACC3 has potential as a new therapeutic approach for non-small cell lung cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,151

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,450
Écart entre enseignants0,409 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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