Use of genetic instability to predict biochemical recurrence in intermediate-risk prostate cancer.
Notice bibliographique
Résumé
42 Background: Biomarkers of local and systemic recurrence are needed to individualize patient risk categories and better define treatment. We hypothesized that genomic instability, as measured by percent genome alteration (PGA), can predict for biochemical failure in intermediate- risk prostate cancer. Methods: High-resolution array comparative genomic hybridization (arrayCGH) was used to identify PGA in frozen biopsies from 120 intermediate-risk prostate cancer patients. Our cohort included 39 T1c tumors, 78 T2 tumors and 2 T3 tumors. The Gleason score was 6 in 32 tumors, 7 in 82 tumors and 8–9 in 6 tumors. PSA ranged from 2.1–33 (median 8.0). Patients were treated with intensity-modulated radiotherapy (IMRT) with doses of 75.6–79.8 Gy in 1.8–2Gy fractions, or 60–66 Gy in 3 Gy fractions.. Twenty-five percent of patients also received neoadjuvant-concurrent bicalutamide (150mg po od). Biochemical failure, defined by Phoenix criteria or the initiation of salvage therapy, was observed in 35 patients after median follow-up of 5.4 years (range 0.9–8.8). Results: Array CGH showed variable PGA ranging from <1% to 35% (median 6.7%). PSA and the use of hormonal therapy independently influenced biochemical relapse, and formed a baseline clinical model to which PGA was added. PGA was found to be a strong predictor of biochemical relapse (p<0.0001) independent of the clinical prognostic factors (pre-treatment PSA, Gleason score and T-category). PGA was also found to be associated with unique tumour suppressor and oncogene gene loci clusters involved in genetic stability (e.g. loss of PTEN, p53, RB, NKX3.1, ATM, PARP-1 and gain of c-MYC; validated by in situ FISH). Conclusions: This is the first report to show genetic instability can independently predict for biochemical recurrence in intermediate-risk prostate cancer. Current studies are associating specific gene loci regions with clinical outcome. Our results could provide a way forward for individualized medicine for non-indolent prostate cancer based on initial daignostic biopsy material. Supported by Prostate Cancer Canada, The Terry Fox Foundation and the Canadian Cancer Society. No significant financial relationships to disclose.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».