Geographical restructuring of <i>Arabidopsis thaliana</i> ’s genetic makeup in the Iberian Peninsula due to climate change based on genetic cluster membership
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Aim To assess the effects of climate change on genetic lineages of Arabidopsis thaliana at the admixed population level by directly modelling genetic cluster membership values to predict potential genetic cluster memberships across the Iberian Peninsula. Location Iberian Peninsula Methods We used a dataset of 274 accessions structured in four genetic clusters as inferred from 250 nuclear single-nucleotide polymorphisms with Bayesian clustering methods. We predicted the change in percentages of genetic cluster membership at a population level and the changes in potential suitability across the study area by combining parametric (Beta regression) and non-parametric (Recursive trees) methods. Results Climate change will affect genetic lineages of Arabidopsis thaliana differently. Genetic clusters GC1 and GC2 will suffer a substantive reduction of their respective suitable areas while GC3 and GC4 will expand northward. At the population level, except for GC4, the rest of the lineages will undergo a genetic turnover for many of their populations. Main conclusions A. thaliana in the Iberian Peninsula will undergo a major internal genetic restructuring and range change due to climate change. Genetic lineages of Arabidopsis thaliana in the Iberian Peninsula will be affected differently which reinforce the need for taking into account intraspecific genetic variation when modelling species distribution. Despite limited predictive power of individual statistical models, the combination of distinct models can compensate this shortcoming.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».