Total Synthesis of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Dideoxymycobactin‐838 and Stereoisomers: Diverse CD1a‐Restricted T Cells Display a Common Hierarchy of Lipopeptide Recognition
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium tuberculosis produces dideoxymycobactin-838 (DDM-838), a lipopeptide that potently activates T cells upon binding to the MHC-like antigen-presenting molecule CD1a. M. tuberculosis produces DDM-838 in only trace amounts and a previous solid-phase synthesis provided sub-milligram quantities. We describe a high-yielding solution-phase synthesis of DDM-838 that features a Mitsunobu substitution that avoids yield-limiting epimerization at lysine during esterification, and amidation conditions that prevent double-bond isomerization of the Z-C20:1 acyl chain, and provides material with equivalent antigenicity to natural DDM-838. Isomers of DDM-838 that varied in stereochemistry at the central lysine and the C20:1 acyl chain were compared for their ability to be recognised by CD1a-restricted T cell receptors (TCRs). These TCRs, derived from unrelated human donors, exhibited a similar spectrum of reactivity towards the panel of DDM-838 isomers, highlighting the exquisite sensitivity of lipopeptide-reactive T cells for the natural DDM stereochemistry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».