High Incidence of Invasive Group A Streptococcal Infections in Remote Indigenous Communities in Northwestern Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Worldwide, indigenous populations appear to be at increased risk for invasive group A streptococcal (iGAS) infections. Although there is empirical evidence that the burden of iGAS disease is significant among remote First Nations communities in Northwestern Ontario, Canada, the epidemiology of iGAS infections in the area remains poorly characterized. Methods Individuals that met case definition for iGAS disease and whose laboratory specimens were processed by Meno Ya Win Health Centre in Sioux Lookout, Canada or who were reported to Thunder Bay District Health Unit, Canada were identified for the period 2009 to 2014. Case demographics, clinical severity, comorbidities, and risk factors were collected through chart review. Strain typing and antibiotic susceptibility were determined when possible. Basic descriptive statistics were calculated. Results Sixty-five cases of iGAS disease were identified, for an annualized incidence of 56.2 per 100 000. Primary bacteremia was present in 26.2% of cases, and cellulitis was identified in 55.4% of cases. The most common comorbidities identified were diabetes (38.5%) and skin conditions (38.5%). Prevalent risk factors included alcohol dependence (25%). Fourteen different emm types were identified among 42 isolates, with the most common being emm114 (17.4%), emm11 (15.2%), and emm118 (13.0%). Resistance to erythromycin and clindamycin was found in 24.6% of isolates. Conclusions Rural and remote First Nations communities in Northwestern Ontario experience iGAS infections at a rate 10 times the provincial and national average. Compared with other North American series, a lower proportion of isolates causing infection were of emm types included in candidate GAS vaccines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».