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Enregistrement W2561506493 · doi:10.1093/ofid/ofw172.1668

Safety and Efficacy of Fecal Microbiota Transplantation for Recurrent Clostridium difficile Infection From An International Public Stool Bank: Results From a 2050-Patient Multicenter Cohort

2016· article· en· W2561506493 sur OpenAlexaff
Majdi Osman, Kelsey OʼBrien, Zachery Stoltzner, Kelly Ling, Emily Koelsch, Nancy Dubois, Adila Khoiri, Kanchana Amaratunga, Mark Smith, Zain Kassam

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClostridium difficileFecal bacteriotherapyMedicineFecesC difficileCohortTransplantationInternal medicineCohort studyClostridioidesIntensive care medicineMicrobiologyAntibioticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Clostridium difficile infection (CDI) is a public health threat, and fecal microbiota transplantation (FMT) appears to be an effective therapy. Recently, universal stool banks have emerged to enable safe and seamless access to FMT. However, there is a paucity of real-world safety and efficacy data from stool banks. Methods. Quality assurance data on CDI classification, FMT delivery modality, and clinical efficacy were consecutively collected from 482 healthcare facilities across 50 US states and 7 countries between 16 January 2014 and 12 April 2016. The primary outcome was physician-reported clinical cure as per standard of care follow-up. Safety data were assessed through mandatory adverse event (AE) reporting. Descriptive statistics and chi-square analyses for binomial variables were conducted. Results. Among consecutively collected reports, complete safety and efficacy data was returned for 2050 patients, which were included in these analyses. Overall, the clinical cure rate from physician-reported data across all delivery modalities and CDI patient populations was 84.0%. The most common indication for FMT, recurrent CDI, had an 87.0% (1150/1322) clinical cure rate by lower gastrointestinal (GI) delivery (figure 1). Across the entire cohort, 85.0% (n = 1742) of patients were treated with 250-mL lower GI delivery fecal microbiota preparation and 15.0% used 30-mL upper GI delivery fecal microbiota preparation. FMT by colonoscopy (85.8% clinical cure, n = 1441) was superior to that by upper endoscopy (74.1% clinical cure, n = 201) (P < 0.01). The relationship between fecal preparation type and efficacy was statistically significant (P < 0.05), with 85.1% efficacy for 250-mL preparations and 77.9% efficacy for 30-mL preparations. CDI classification had a statistically significant impact on the rate of clinical efficacy (figure 1). From a safety perspective, 42 AEs were reported; however, no AE was determined to be definitely related to FMT, 3 were possibly related to FMT, and 39 were not related based on National Institutes of Health criteria. Conclusion. To our knowledge, this is the largest FMT study reported, and the results suggest that in a large, real-world patient cohort that includes severe and refractory CDI patients, FMT from a public stool bank can be a safe and effective treatment for CDI not responsive to standard therapy. Disclosures. M. Osman, OpenBiome: Employee, Salary; K. O'Brien, OpenBiome: Employee, Salary; Z. Stoltzner, OpenBiome: Employee, Salary; K. Ling, OpenBiome: Employee, Salary; E. Koelsch, OpenBiome: Employee, Salary; N. Dubois, OpenBiome: Employee, Salary; M. Smith, OpenBiome: Employee, Salary; Finch: Board Member, Employee and Shareholder, Equity and Salary; Z. Kassam, OpenBiome: Employee, Salary; Finch Therapeutics: Consultant and Shareholder, Equity and Research support

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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