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Enregistrement W2561547425 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-2292

Abstract 2292: The role of immature colon carcinoma transcript 1 during c-myc deregulation in fast-onset mouse plasmacytoma

2015· article· en· W2561547425 sur OpenAlexaff
Amy Dahl, Ruedee Sakulratchata, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMolecular biologyRetrovirusApoptosisMetaphaseTransfectionCancer researchChromosomal translocationCell cultureGeneChromosomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Murine plasmacytoma (mPCT) models human blood cancers that involve the deregulation of c-myc by a translocation that juxtaposes c-myc to one of the immunoglobin loci. The fast-developing mPCT does not depend on c-myc translocation; rather infection with v-abl/c-myc retrovirus produces elevated c-myc levels. Chromosome 11 subcytoband E2 is always (100%) found duplicated compared to slow-developing mPCT (7.1%). The gene, immature colon carcinoma transcript1 (ict1) is located within 11E2 and overexpressed as a result of 11E2 duplication. The effect of ict1 overexpression during c-myc deregulation may contribute to the aggressive development of mPCT. Here we look at the tumorigenic potential of ict1 in vitro. The ict1 gene has been cloned into an Ecdysone inducible vector and transiently transfected (Nucleofection) into mouse PreB cells that also have inducible c-myc expression activated by 4-hydroxytamoxifen. This allows us to look at overexpression of ict1 along with c-myc simultaneously or each separately. Immunofluorescence was used to confirm overexpression of the target genes. Proliferation and apoptosis levels were determined for each condition by Edu and TUNEL assay respectively. Metaphase spreads were prepared before and after each experiment. We have confirmed by immunofluorescence overexpression of ict1 using the inducible vector system. A study in these cell lines shows that ict1 overexpression increases cell proliferation levels, and may reduce apoptosis compared to cells that were not induced for ict1/c-myc expression. Metaphase spreads show normal diploid chromosome number of 40 (at time 0, and every 24 hours). Further genetic analysis to identify any chromosomal abnormalities that may account for these changes will be performed (SKY). We have identified a potential role of ict1 overexpression in vitro. In order to further explore these results we will try to restore proliferation and apoptotic levels relative to a normal PreB cell phenotype in plasmacytoma cells in vitro in the MOPC 460D cell line, and ex vivo in plasmacytoma cells isolated from PCT-carrying mice. 11E2 is syntenic to human chromosome 17q25, which has chromosomal abnormalities in many other neoplasms, such as acute and chronic myeloid leukemia, neuroblastoma, breast, ovarian, thyroid cancers. If we can identify the role of overexpression of ict1 during c-myc deregulation in fast-onset mPCT, we can gain insight into the aggressiveness of the disease progression and determine if ict1 could lead to a new therapeutic target for aggressive blood cancers with c-myc deregulation. Citation Format: Amy K. Dahl, Ruedee Sakulratchata, Sabine Mai. The role of immature colon carcinoma transcript 1 during c-myc deregulation in fast-onset mouse plasmacytoma. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 2292. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-2292

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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Résumé présentoui

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