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Enregistrement W2561696552 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-lb-075

Abstract LB-075: The histone demethylase JMJD1A is essential to prostate cancer cells through regulation of c-Myc expression

2015· article· en· W2561696552 sur OpenAlexaff
Lingling Fan, Guihong Peng, Natasha Sahgal, Ladan Fazli, Martin Gleave, Yuji Zhang, Arif Hussain, Jianfei Qi

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDemethylaseGene knockdownCancer researchGene silencingBiologyProstate cancerCancer cellEZH2EpigeneticsCell growthCell cycleMolecular biologyCancerChemistryApoptosisGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Histone demethylase JMJD1A controls gene expression by epigenetic regulation of H3K9 methylation marks. To investigate role of JMJD1A in the development and progression of prostate cancer, we knock down JMJD1A in prostate cancer cells and examine its effect on gene expression and cancer cell biology. We find that silencing of JMJD1A results in the lethality of prostate cancer cells concomitant with inhibition of cell proliferation, induction of apoptosis and cell cycle arrest. Profiling array analyses reveal c-Myc as one of the top transcriptional networks altered upon the JMJD1A inhibition. The gene ontology pathway analyses show that the primary functions of c-Myc targets regulated by JMJD1A are related to cell cycle, cell proliferation and cell survival. Mechanistically, JMJD1A promotes the recruitment of AR and induces demethylation at the c-Myc gene enhancer, thereby increasing the AR-dependent transcription of c-Myc mRNA. In a parallel pathway, JMJD1A binds to E3 ubiquitin ligase HUWE1, attenuates the HUWE1-induced degradation of c-Myc, and thus increases the c-Myc protein level. Together, JMJD1A controls the expression of c-Myc at transcriptional and post-translational levels. Re-expression of c-Myc in the JMJD1A-knockdown cells partly recues the growth of prostate cancer cells in vitro and in vivo. The protein level of c-Myc is positively correlated with that of JMJD1A in a subset of human prostate cancer specimens. Collectively, our findings identify a critical role of JMJD1A for the viability of prostate cancer cells through regulation of c-Myc expression. Note: This abstract was not presented at the meeting. Citation Format: Lingling Fan, Guihong Peng, Natasha Sahgal, Ladan Fazli, Martin Gleave, Yuji Zhang, Arif Hussain, Jianfei Qi. The histone demethylase JMJD1A is essential to prostate cancer cells through regulation of c-Myc expression. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr LB-075. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-LB-075

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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