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Enregistrement W2561717660 · doi:10.1128/jb.00690-16

Legionella pneumophila OxyR Is a Redundant Transcriptional Regulator That Contributes to Expression Control of the Two-Component CpxRA System

2016· article· en· W2561717660 sur OpenAlexaff
Jennifer R. Tanner, Palak Patel, Jacqueline Hellinga, Lynda J. Donald, Celine Jimenez, Jason J. LeBlanc, Ann Karen C. Brassinga

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie UniversityUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLegionella pneumophilaRepressorOperonMicrobiologyPromoterGeneResponse regulatorRegulation of gene expressionEscherichia coliBacteriaGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Nominally an environmental organism, Legionella pneumophila is an intracellular parasite of protozoa but is also the causative agent of the pneumonia termed Legionnaires' disease, which results from inhalation of aerosolized bacteria by susceptible humans. Coordination of gene expression by a number of identified regulatory factors, including OxyR, assists L. pneumophila in adapting to the stresses of changing environments. L. pneumophila OxyR (OxyR Lp ) is an ortholog of Escherichia coli OxyR; however, OxyR Lp was shown elsewhere to be functionally divergent, such that it acts as a transcription regulator independently of the oxidative stress response. In this study, the use of improved gene deletion methods has enabled us to generate an unmarked in-frame deletion of oxyR in L. pneumophila . Lack of OxyR Lp did not affect in vitro growth or intracellular growth in Acanthamoeba castellanii protozoa and U937-derived macrophages. The expression of OxyR Lp does not appear to be regulated by CpxR, even though purified recombinant CpxR bound a DNA sequence similar to that reported for CpxR elsewhere. Surprisingly, a lack of OxyR Lp resulted in elevated activity of the promoters located upstream of icmR and the lpg1441-cpxA operon, and OxyR Lp directly bound to these promoter regions, suggesting that OxyR Lp is a direct repressor. Interestingly, a strain overexpressing OxyR Lp demonstrated reduced intracellular growth in A. castellanii but not in U937-derived macrophages, suggesting that balanced expression control of the two-component CpxRA system is necessary for survival in protozoa. Taken together, this study suggests that OxyR Lp is a functionally redundant transcriptional regulator in L. pneumophila under the conditions evaluated herein. IMPORTANCE Legionella pneumophila is an environmental pathogen, with its transmission to the human host dependent upon its ability to replicate in protozoa and survive within its aquatic niche. Understanding the genetic factors that contribute to L. pneumophila survival within each of these unique environments will be key to limiting future point-source outbreaks of Legionnaires' disease. The transcriptional regulator L. pneumophila OxyR (OxyR Lp ) has been previously identified as a potential regulator of virulence traits warranting further investigation. This study demonstrated that oxyR is nonessential for L. pneumophila survival in vitro and in vivo via mutational analysis. While the mechanisms of how OxyR Lp expression is regulated remain elusive, this study shows that OxyR Lp negatively regulates the expression of the cpxRA two-component system necessary for intracellular survival in protozoa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,320

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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