Elucidating genetic events in human hepatocellular carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
e15590 Background: Hepatocellular carcinoma (HCC) is prevalent world wide with increasing incidence in North America. 4q is a commonly deleted region in HCC and is lost in 32% of premalignant cirrhotic nodules but the precise molecular lesion involved in tumor initiation remains unknown. Human Plk4, a member of the polo family of cell cycle regulating serine /threonine kinases is located on 4q28. Plk4 is a haploinsufficient tumor suppressor in mice, with 50% of animals developing spontaneous tumors, most commonly multifocal primary HCC. We hypothesize that Plk4 plays a role in the initiation of human HCC. Our purpose was to determine the levels of Plk4 in human HCC and investigate possible genetic interactions with the tumor suppressor p53. Methods: Formalin-fixed paraffin-embedded sections of human HCCs, adjacent non-neoplastic liver tissue and gallbladder tissue were microdissected. DNA was extracted and manual LOH analysis was performed. To asses Plk4 expression, RNA from the hepatoma cases was used for real time RT-PCR. To elucidate a genetic interaction, Plk4 p53 compound mutant mice were generated and murine embryonic fibroblasts (MEFs) were derived and cultured. Results: In HCC Plk4 LOH rates varied from 57% for the marker closest to Plk4 to 8% for the marker furthest away (n=32). Using an intragenic marker the rate of LOH was 45% (n=24). Studies in CRC (n=46) and pancreas cancer specimens (n=40) showed only background levels of LOH. Expression of Plk4 in HCC tumor samples that displayed LOH at the Plk4 locus was reduced compared to non-neoplastic liver. Plk4±p53−/− mice showed acceleration of tumor formation compared to Plk4+/+p53−/− mice. Plk4±p53−/− MEFs had increased levels multinucleation, centrosome amplification and aneuploidy compared to Plk4+/+p53−/− cells. In addition these cells were tumorigenic in vivo whereas Plk4+/+p53−/− cells were not. Conclusions: Our results demonstrate significant rates of LOH at the Plk4 locus specifically in human HCC and indicate that this is associated with decreased Plk4 expression. In addition, our studies of compound mutant mice suggest a possible genetic interaction of Plk4 and p53 in tumor development. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».