Association of excision repair cross-complementation group 1 (ERCC1) gene expression (GE) with outcome in stage II-III esophageal adenocarcinoma (EA) patients treated with preoperative platinum-based chemoradiation (CRT) in a phase II cooperative study (SWOG 0356).
Notice bibliographique
Résumé
2 Background: Preoperative platinum-based CRT for operable esophageal cancer has improved overall survival (OS) compared to surgery alone. The phase II SWOG 0356 trial designed to test oxaliplatin (OXP) plus infusion 5-fluorouracil (5-FU) and external beam radiation prior to surgery for potentially curable EA has produced promising centrally confirmed complete pathologic response (pCR) rate (28.3%). After surgery patients were given a second cycle of OXP and 5FU. 2-year OS was 54.2%. However, treatment efficacy may be significantly compromised as a result of interindividual variations. We tested whether intratumoral GE levels in drug metabolism (DPD, GSTPi, TS and TP) and DNA repair (ERCC1 and XPD) predicted clinical outcome (CO). We also tested whether specific pattern of 12 polymorphisms in 8 genes (drug metabolism (GSTP, MTHFR and TS) and DNA repair (ERCC1, RAD51, XPD, XRCC1 and XRCC3)) predicted CO. Methods: A total of 90 patients from the SWOG 0356 study were eligible for the molecular correlative study. mRNA was extracted from laser-capture-microdissected tumor tissue. After cDNA was prepared by reverse transcription, quantitation of the candidate genes and an internal reference gene (ß-actin) was performed using a fluorescence-based real-time detection method (TaqMan). Established GE cutoffs were tested (ERCC1 <1.7 x 10-3; TS <4.0 x 10-3). DNA was extracted from blood and genotyped using PCR-RFLP techniques. Results: In univariate analysis, we found ERCC1 GE levels to be significantly associated with progression-free survival (PFS) and OS. Patients with high ERCC1 GE levels had worse 2-year PFS (17 vs 67%, p=0.004) and 2-year OS (37 vs 72%, p=0.04) compared to low GE levels. ERCC1 GE levels were not associated with pCR. All the other GE levels tested did not show significant association with CO. None of the tested polymorphisms showed any association with CO. Conclusions: Our data suggest that GE levels of ERCC1 may help to identify patients with stage II-III EA likely to experience longer survival when treated with preoperative OXP-based CRT. No significant financial relationships to disclose.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».