Structural investigation on WlaRG from <i>Campylobacter jejuni</i>: A sugar aminotransferase
Notice bibliographique
Résumé
Campylobacter jejuni is a Gram-negative bacterium that represents a leading cause of human gastroenteritis worldwide. Of particular concern is the link between C. jejuni infections and the subsequent development of Guillain-Barré syndrome, an acquired autoimmune disorder leading to paralysis. All Gram-negative bacteria contain complex glycoconjugates anchored to their outer membranes, but in most strains of C. jejuni, this lipoglycan lacks the O-antigen repeating units. Recent mass spectrometry analyses indicate that the C. jejuni 81116 (Penner serotype HS:6) lipoglycan contains two dideoxyhexosamine residues, and enzymological assay data show that this bacterial strain can synthesize both dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-d-glucose and dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-d-galactose. The focus of this investigation is on WlaRG from C. jejuni, which plays a key role in the production of these unusual sugars by functioning as a pyridoxal 5'-phosphate dependent aminotransferase. Here, we describe the first three-dimensional structures of the enzyme in various complexes determined to resolutions of 1.7 Å or higher. Of particular significance are the external aldimine structures of WlaRG solved in the presence of either dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-d-galactose or dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose. These models highlight the manner in which WlaRG can accommodate sugars with differing stereochemistries about their C-4' carbon positions. In addition, we present a corrected structure of WbpE, a related sugar aminotransferase from Pseudomonas aeruginosa, solved to 1.3 Å resolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».