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Enregistrement W2562075881 · doi:10.1128/mcb.00537-16

ArfGAP Domain-Containing Protein 2 (ADAP2) Integrates Upstream and Downstream Modules of RIG-I Signaling and Facilitates Type I Interferon Production

2016· article· en· W2562075881 sur OpenAlexafffund
Pradeep Bist, Susana Soo-Yeon Kim, Niyas Kudukil Pulloor, Kathleen McCaffrey, Sajith Nair, Yiliu Liu, Rongtuan Lin, Manoj N. Krishnan

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMinistry of Education - SingaporeNational Research Foundation SingaporeGovernment of Canada
Mots-clésIRF3BiologySignal transducing adaptor proteinInterferon regulatory factorsCell biologyTRIFInterferonRIG-ITranscription factorSignal transductionInterferon type ITANK-binding kinase 1Protein subunitPhosphorylationRNAProtein kinase AGeneVirologyReceptorGeneticsInnate immune systemToll-like receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transcription of type I interferon genes during RNA virus infection requires signal communication between several pattern recognition receptor (PRR)-adaptor complexes located at distinct subcellular membranous compartments and a central cytoplasmic TBK1-interferon regulatory factor 3 (IRF3) kinase-transcription factor module. However, how the cell integrates signal transduction through spatially distinct modules of antiviral signaling pathways is less defined. RIG-I is a major cytosolic PRR involved in the control of several RNA viruses. Here we identify ArfGAP domain-containing protein 2 (ADAP2) as a key novel scaffolding protein that integrates different modules of the RIG-I pathway, located at distinct subcellular locations, and mediates cellular antiviral type I interferon production. ADAP2 served to bridge the mitochondrial membrane-bound upstream RIG-I adaptor MAVS and the downstream cytosolic complex of NEMO (regulatory subunit of TBK1), TBK1, and IRF3, leading to IRF3 phosphorylation. Furthermore, independently, ADAP2 also functioned as a major orchestrator of the interaction of TBK1 with NEMO and IRF3. Mutational and in vitro cell-free reconstituted RIG-I signaling assay-based analyses identified that the ArfGAP domain of ADAP2 mediates the interferon response. TRAF3 acted as a trigger for ADAP2 to recruit RIG-I pathway component proteins into a single macromolecular complex. This study provides important novel insights into the assembly and integration of different modules of antiviral signaling cascades.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,595

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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