Methylomic profiling of cortex samples from completed suicide cases implicates a role for PSORS1C3 in major depression and suicide
Notice bibliographique
Résumé
Major depressive disorder (MDD) represents a major social and economic health issue and constitutes a major risk factor for suicide. The molecular pathology of suicidal depression remains poorly understood, although it has been hypothesised that regulatory genomic processes are involved in the pathology of both MDD and suicidality. In this study, genome-wide patterns of DNA methylation were assessed in depressed suicide completers (n=20) and compared with non-psychiatric, sudden-death controls (n=20) using tissue from two cortical brain regions (Brodmann Area 11 (BA11) and Brodmann Area 25 (BA25)). Analyses focused on identifying differentially methylated regions (DMRs) associated with suicidal depression and epigenetic variation were explored in the context of polygenic risk scores for major depression and suicide. Weighted gene co-methylation network analysis was used to identify modules of co-methylated loci associated with depressed suicide completers and polygenic burden for MDD and suicide attempt. We identified a DMR upstream of the PSORS1C3 gene, subsequently validated using bisulfite pyrosequencing and replicated in a second set of suicide samples, which is characterised by significant hypomethylation in both cortical brain regions in MDD suicide cases. We also identified discrete modules of co-methylated loci associated with polygenic risk burden for suicide attempt, but not major depression. Suicide-associated co-methylation modules were enriched among gene networks implicating biological processes relevant to depression and suicidality, including nervous system development and mitochondria function. Our data suggest that there are coordinated changes in DNA methylation associated with suicide that may offer novel insights into the molecular pathology associated with depressed suicide completers.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».