MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2562823897 · doi:10.5897/ajps2015.1294

Re-evaluating TiCl4 and UV assays for detection of vicine and convicine in high-throughput screening of immature and mature seeds of faba bean

2015· article· en· W2562823897 sur OpenAlexaff
Ferhatoglu Yurdagul, V A Albert

Notice bibliographique

RevueAfrican Journal of Plant Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVicia fabaBiologyCropTrichloroacetic acidAbsorption (acoustics)HorticultureAgronomyBiochemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic resources have just started to focus on the faba bean; the genes for synthesis of vicine and convicine (V-C) have not been determined, and recently developed genetic markers for these anti-nutritionals have not been used to examine these traits in very large scale in faba bean. Simple, rapid and cost-effective technologies are crucial in crop breeding programs, especially in the developing world, and in some cases, traditional methodologies are used in combination with genetic markers to assess agronomic traits and the value of gene markers. Here, two methodologies (TiCl4 assay and 274 nm absorption) are re-evaluated for their application in detection of V-C in faba beans. In comparison with TiCl4 assay, the method of 274 nm UV absorption without an HPLC analysis offers more reliable analysis for detection of V-C in immature and mature seeds of faba bean. Its application in high throughput screening by 60 min agitation of immature seeds or mature seed flour in 2% trichloroacetic acid (TCA) allows quick screening of low V-C faba beans. The level of V-C was maximum when seed moisture was 80% and V-C level was measured as 0.92% in CDC Fatima flour. Though V-C from 2% TCA extract of mature and immature seeds of CDC Fatima was detected by 274 wavelength in the TiCl4 assay reaction, a Ti-aglycone complex was not clearly detectible at 480 nm as previously suggested. Key words: Vicine, convicine, TiCl4 assay, UV assay, high throughput, seed, faba bean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAfrican Journal of Plant ScienceMême sujetGenetic and Environmental Crop StudiesTravaux en français237 207