SFRP1 promoter methylation and its contribution to endometrial tumorigenesis
Notice bibliographique
Résumé
B137 Purpose: The secreted frizzled-related protein 1 (SFRP1) encodes a wnt/beta-catenin signalling antagonist and is frequently inactivated by promoter hypermethylation in tumors. We hypothesized that epigenetic inactivation of SFRP1 may be causally involved in the development of endometrial cancer. We undertook a study to examine the contribution of SFRP1 promoter methylation and its association with tumor microsatellite instability (MSI) status among patients with endometrial carcinomas of the endometriod type. Methods: Formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections of endometrial adenocarcinomas and matched normal tissue specimens were obtained from patients (n=56) and DNA was extracted from microdissected specimens enriched for tumor and normal cell populations. MSI status was determined using five National Cancer Institute (NCI) consensus panel markers and the methylation status of SFRP1 promoter was analyzed by methylation-specific PCR (MSPCR) assay of sodium bisulfite treated DNA obtained from these specimens. Beta-catenin expression was assessed in a subset of endometrial tumors by immunohistochemistry. Results: We found that a majority of tumors (87%) show some degree of SFRP1 promoter methylation at the region examined, however 16% of tumors showed exclusive hypermethylation in tumors. There were 30 MSS and 26 MSI endometrial cancer cases. No significant correlation was observed with either tumor MSI status or with strong nuclear beta-catenin expression. Conclusion: Epigenetic inactivation of SFRP1 is a common event in endometrial cancer. It is possible that for a small subset of cases, SFRP1 promoter hypermethylation may play a role in tumorigenesis either through Wnt or an alternative pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».