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Enregistrement W2563441308 · doi:10.1111/eth.12576

Variation in Reproductive Success Across Captive Populations: Methodological Differences, Potential Biases and Opportunities

2016· article· en· W2563441308 sur OpenAlexaff
Simon C. Griffith, Ondi L. Crino, Samuel C. Andrew, Fumiaki Y. Nomano, Elizabeth Adkins–Regan, Carlos Alonso‐Álvarez, Ida E. Bailey, Stephanie Bittner, Peri E. Bolton, Winnie Boner, Neeltje J. Boogert, Ingrid C. A. Boucaud, Michael Briga, Katherine L. Buchanan, Barbara A. Caspers, Mariusz Cichoń, David F. Clayton, Sébastien Derégnaucourt, Wolfgang Forstmeier, Lauren M. Guillette, Ian R. Hartley, Susan D. Healy, Davina L. Hill, Marie–Jeanne Holveck, Laura L. Hurley, Malika Ihle, E. Tobias Krause, Mark C. Mainwaring, Valeria Marasco, Mylène M. Mariette, Meghan S. Martin‐Wintle, Luke S. C. McCowan, Maeve McMahon, Pat Monaghan, Ruedi G. Nager, Marc Naguib, Andreas Nord, Dominique A. Potvin, Nora H. Prior, Katharina Riebel, Ana Á. Romero‐Haro, Nick J. Royle, Joanna Rutkowska, Wiebke Schuett, John P. Swaddle, Michael Tobler, Larissa Trompf, Claire W. Varian‐Ramos, Clémentine Vignal, Avelyne S. Villain, Tony D. Williams

Notice bibliographique

RevueEthology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Behavior and Reproduction
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British ColumbiaWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaptivityBiologyTaeniopygiaZebra finchVariation (astronomy)Captive breedingReproductive successEcologyZoologyEvolutionary biologyHabitatPopulationDemographyEndangered species

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Our understanding of fundamental organismal biology has been disproportionately influenced by studies of a relatively small number of ‘model’ species extensively studied in captivity. Laboratory populations of model species are commonly subject to a number of forms of past and current selection that may affect experimental outcomes. Here, we examine these processes and their outcomes in one of the most widely used vertebrate species in the laboratory – the zebra finch (Taeniopygia guttata). This important model species is used for research across a broad range of fields, partly due to the ease with which it can be bred in captivity. However despite this perceived amenability, we demonstrate extensive variation in the success with which different laboratories and studies bred their subjects, and overall only 64% of all females that were given the opportunity, bred successfully in the laboratory. We identify and review several environmental, husbandry, life‐history and behavioural factors that potentially contribute to this variation. The variation in reproductive success across individuals could lead to biases in experimental outcomes and drive some of the heterogeneity in research outcomes across studies. The zebra finch remains an excellent captive animal system and our aim is to sharpen the insight that future studies of this species can provide, both to our understanding of this species and also with respect to the reproduction of captive animals more widely. We hope to improve systematic reporting methods and that further investigation of the issues we raise will lead both to advances in our fundamental understanding of avian reproduction as well as to improvements in future welfare and experimental efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,097
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,131
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,903
Score d'incertitude au seuil0,514

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0970,131
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,382
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,001 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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