Ammoniated Complexes of Uracil and Transition Metal Ions: Structures of [M(Ura-H)(Ura)(NH<sub>3</sub>)]<sup>+</sup>by IRMPD Spectroscopy and Computational Methods (M = Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Cd)
Notice bibliographique
Résumé
The structures of deprotonated d-block metal dication bound uracil dimers, solvated by a single ammonia molecule, were explored in the gas phase using infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectroscopy in a Fourier transform ion cyclotron resonance-mass spectrometer. The IRMPD spectra were then compared with computed IR spectra for various isomers. Calculations were performed using B3LYP with the 6-31+G(d,p) basis set for all atoms, with the exception of Cd, for which the LANL2DZ basis set with relativistic core potentials was used. The calculations were then repeated using the def2-TZVPP basis set on all atoms and were compared to the first set of calculations. The lowest-energy structures are those in which one uracil is deprotonated at the N3 position and, aside from the Cu complex, the intact uracil is a tautomer in which the N3 hydrogen is at the O4 carbonyl oxygen. The metal displays a tetradentate interaction to the uracil moieties, with the exception of Cu, which is tridentate, and the ammonia molecule is bound directly to the metal center. In the Cu complex, a square planar geometry is observed about the metal center, consistent with Jahn-Teller distortions commonly observed in Cu(II) complexes, and the intact uracil assumes its canonical tautomer. All other metal cation complexes are five-coordinate, square pyramidal complexes, with the intact uracil adopting a tautomer in which the N3 hydrogen is on O4. The IRMPD spectroscopic data are consistent with the computed infrared spectra for the lowest-energy structures in all cases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».