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Enregistrement W2563787473 · doi:10.1016/j.ijid.2016.11.296

Canadian strategies for systematically assessing risks posed by emerging infectious diseases

2016· article· en· W2563787473 sur OpenAlexaffabout
Monique St-Laurent, G. Thomas-Reilly, Alex Demarsh, Stephan Gadient

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPublic healthGovernment (linguistics)Zika virusAgency (philosophy)MeaslesEmerging infectious diseaseScale (ratio)Public relationsEnvironmental healthRisk analysis (engineering)BusinessMedicinePolitical scienceGeographyDiseaseCartographyVaccinationVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: How can the Canadian Government systematically assess and prioritize emerging infectious diseases (EID) in order to inform public health responses?Methods & Materials: The Public Health Agency of Canada (PHAC), an agency of the Government of Canada, is tasked to prevent and control infectious diseases and prepare for and respond to public health emergencies, amongst other core functions described within the mandate 1 .In recent years PHAC has been challenged to respond, in a timely manner, to a range of emerging infectious diseases and public health events.In order to enhance capacity the need for a systematic risk assessment platform for EIDs was identified.The creation of a Rapid Public Health Risk Assessment Framework (RPHRAF) involved a scan of existing frameworks in order to identify common themes and structures.A literature review was conducted to broaden the evidence base.A subject-matter working group then convened to provide feedback on a draft framework and the prototype was then tested in a tabletop exercises.Finally, the RPHRAF was piloted on several real-time EID events, including: H5N1, Ebola, Measles and the Zika virus scale-up.Results: The prototype framework proved to be effective and beneficial during the initial table-top and real-time tests.The framework promoted a shared understanding of risk assessments, a common vocabulary across a large government agency and response triggers for EID events.A subsequent real-time test during PHAC's scale-up for the Zika virus revealed some weaknesses relating to vector-borne diseases and incongruence between data inputs and algorithms and risk assessments.Conclusion: Drawing from the lessons learned during the testing phase of this framework, PHAC is now embarking on a revised version.The revisions will seek to make the framework more generic and capable of assessing a range of domestic and global EID events.As a part of this process PHAC will be developing systematic documentation standards and repositories, as well as event-specific risk scores.Canada is a Federal state, comprised of provinces, territories (PT) and the federal government.An additional requirement of the revised RPHRAF will be stakeholder input from our PT and nongovernmental counterparts to ensure inter-operability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,111
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,174
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,743
Score d'incertitude au seuil0,862

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1110,174
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0340,026
Études des sciences et des technologies0,0180,012
Communication savante0,0180,008
Science ouverte0,0100,020
Intégrité de la recherche0,0040,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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