Histone gene expression is regulated by histone H2B ubiquitylation in fission yeast
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cell cycle-regulated expression of histone genes is vital for coordination of DNA replication with chromatin assembly. In yeast, histone genes are regulated by transcriptional activation in S phase and transcriptional repression in other phases of the cell cycle, although the mechanisms are poorly understood. Here we describe a role for histone H2B monoubiquitylation (H2Bub1), a histone mark that is linked to RNA polymerase II transcription elongation, in the activation of replication-dependent histone genes in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe . Loss of H2Bub1 is also associated with a delay in S phase progression and reduced expression of the replication initiation factor Cdc18 (ortholog of Cdc6). We provide evidence that H2Bub1 impacts histone gene transcription and acts through a mechanism that involves the 3’UTR. Consistent with our previous finding that H2Bub1 is functionally opposed to the elongation factor Cdk9, we also find that the effects of H2Bub1 on histone genes are suppressed by reduction in the activity of Cdk9. Our data suggest that H2Bub1 promotes cell growth by activating cell cycle-regulated genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».