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Enregistrement W2564219340 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-5297

Abstract 5297: Chromosomal instability as a prognostic marker in cervical cancer

2015· article· en· W2564219340 sur OpenAlexaff
Christine How, Jeff Bruce, Jonathan So, Melania Pintilie, Benjamin Haibe‐Kains, Angela Bik‐Yu Hui, Blaise Clarke, David W. Hedley, Rićhard P. Hill, Michael Milosevic, Anthony Fyles, Kenneth W. Yip, Fei‐Fei Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCervical cancerMedicineHazard ratioCancerOncologyInternal medicineCohortChromosome instabilityProportional hazards modelGastroenterologyGeneConfidence intervalBiologyGeneticsChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Previous studies have demonstrated that chromosomal instability (CIN) is a consistent feature of the majority of solid tumors. In this current study, we sought to examine the published CIN70 gene signature in a cohort of cervical cancer patients treated at the Princess Margaret (PM) Cancer Centre (n = 79) and an independent cohort of The Cancer Genome Atlas (TCGA) cervical cancer patients (n = 130). Patients with a high CIN70 score had a higher number of copy number alterations (Spearman's correlation coefficient (r) = 0.28, p<0.001), and a higher percentage of genome altered (r = 0.19, p = 0.016). According to Kaplan-Meier analysis, the CIN70 signature achieved borderline significance for para-aortic nodal or distant relapse, with a hazard ratio of 3.02 and Wald p-value of 0.05, but not significant for overall, disease-free survival, or local relapse. In summary, these findings demonstrate that chromosomal instability plays an important role in cervical cancer, and is significantly associated with patient outcome. For the first time, this CIN70 gene signature provided prognostic value for patients with cervical cancer. Citation Format: Christine How, Jeff Bruce, Jonathan So, Melania Pintilie, Benjamin Haibe-Kains, Angela Hui, Blaise Clarke, David Hedley, Richard Hill, Michael Milosevic, Anthony Fyles, Kenneth W. Yip, Fei-Fei Liu. Chromosomal instability as a prognostic marker in cervical cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 5297. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-5297

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,448
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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