Abstract 5297: Chromosomal instability as a prognostic marker in cervical cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Previous studies have demonstrated that chromosomal instability (CIN) is a consistent feature of the majority of solid tumors. In this current study, we sought to examine the published CIN70 gene signature in a cohort of cervical cancer patients treated at the Princess Margaret (PM) Cancer Centre (n = 79) and an independent cohort of The Cancer Genome Atlas (TCGA) cervical cancer patients (n = 130). Patients with a high CIN70 score had a higher number of copy number alterations (Spearman's correlation coefficient (r) = 0.28, p<0.001), and a higher percentage of genome altered (r = 0.19, p = 0.016). According to Kaplan-Meier analysis, the CIN70 signature achieved borderline significance for para-aortic nodal or distant relapse, with a hazard ratio of 3.02 and Wald p-value of 0.05, but not significant for overall, disease-free survival, or local relapse. In summary, these findings demonstrate that chromosomal instability plays an important role in cervical cancer, and is significantly associated with patient outcome. For the first time, this CIN70 gene signature provided prognostic value for patients with cervical cancer. Citation Format: Christine How, Jeff Bruce, Jonathan So, Melania Pintilie, Benjamin Haibe-Kains, Angela Hui, Blaise Clarke, David Hedley, Richard Hill, Michael Milosevic, Anthony Fyles, Kenneth W. Yip, Fei-Fei Liu. Chromosomal instability as a prognostic marker in cervical cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 5297. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-5297
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».