bla VIM-Producing Enterobactercloacae in Ontario, Canada: Links Between Sewage, Surface Water, and Human Isolates
Notice bibliographique
Résumé
Background. In Canada, carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) are rare and usually imported from CPE-endemic countries. We report 2 patient clusters—none with hospitalizations abroad—of Verona integron-encoded metallo-β-lactamase-producing Enterobacter cloacae (VIM-EC) linked to isolates from water in Ontario, Canada. Methods. We analyzed population-based data from Toronto Invasive Bacterial Diseases Network (TIBDN) surveillance from first identified CPE in 2007 until March 2016 to identify VIM-EC colonized/infected patients. Sewage treatment plants (STP) and 1 watershed (WS) in the population area were sampled in 2015. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and plasmid sequencing (PS) was performed. Results. We identified 10 patients with VIM-EC; median age 76.5 years; median Charlson score 2 (table). Five developed a urinary tract infection; 1 a blood stream infection. Eight patients comprised 2 PFGE clusters: cluster I linked 4 patients from 3 hospitals to a WS sample and cluster II 4 patients from 2 hospitals to an STP sample (Figures 1 and 2). PS showed high similarity between plasmids from cluster II and the WS sample from cluster I, suggesting horizontal gene transfer. None of the 8 patients linked to a cluster had been hospitalized abroad, whereas the patient with a unique PFGE isolate had been hospitalized in Croatia. Description of Patient and Water Samples With VIM-EC 1within 1 year before detection; += died; PD, peritoneal dialysis fluid; U, urine; R, rectal; UTI, urinary tract infection; BSI, blood stream infection. Conclusion. Most VIM-EC in Ontario is autochthonous, and water may be an important reservoir. More work is urgently needed to identify environmental reservoirs for CPE. Disclosures. J. Powis, GSK: Investigator, Research support; S. Poutanen, Merck: Board Member, Honoraria and Speaker honorarium. Paladin Labs: Board Member, Honoraria. Accelerate Diagnostics: Board Member, Honoraria
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».