bla VIM-Producing Enterobactercloacae in Ontario, Canada: Links Between Sewage, Surface Water, and Human Isolates
Notice bibliographique
Résumé
Background. In Canada, carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) are rare and usually imported from CPE-endemic countries. We report 2 patient clusters—none with hospitalizations abroad—of Verona integron-encoded metallo-β-lactamase-producing Enterobacter cloacae (VIM-EC) linked to isolates from water in Ontario, Canada. Methods. We analyzed population-based data from Toronto Invasive Bacterial Diseases Network (TIBDN) surveillance from first identified CPE in 2007 until March 2016 to identify VIM-EC colonized/infected patients. Sewage treatment plants (STP) and 1 watershed (WS) in the population area were sampled in 2015. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and plasmid sequencing (PS) was performed. Results. We identified 10 patients with VIM-EC; median age 76.5 years; median Charlson score 2 (table). Five developed a urinary tract infection; 1 a blood stream infection. Eight patients comprised 2 PFGE clusters: cluster I linked 4 patients from 3 hospitals to a WS sample and cluster II 4 patients from 2 hospitals to an STP sample (Figures 1 and 2). PS showed high similarity between plasmids from cluster II and the WS sample from cluster I, suggesting horizontal gene transfer. None of the 8 patients linked to a cluster had been hospitalized abroad, whereas the patient with a unique PFGE isolate had been hospitalized in Croatia. Description of Patient and Water Samples With VIM-EC 1within 1 year before detection; += died; PD, peritoneal dialysis fluid; U, urine; R, rectal; UTI, urinary tract infection; BSI, blood stream infection. Conclusion. Most VIM-EC in Ontario is autochthonous, and water may be an important reservoir. More work is urgently needed to identify environmental reservoirs for CPE. Disclosures. J. Powis, GSK: Investigator, Research support; S. Poutanen, Merck: Board Member, Honoraria and Speaker honorarium. Paladin Labs: Board Member, Honoraria. Accelerate Diagnostics: Board Member, Honoraria
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».