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Abstract POSTER-BIOL-1312: The role of BRCA and CEBPD in serous ovarian cancer carcinogenesis

2015· article· en· W2564624504 sur OpenAlexaff
Sophia George, Ramlogan Sowamber, Patricia Shaw

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOvarian cancerCancer researchCarcinogenesisFallopian tubeTissue microarrayOvarian carcinomaSerous fluidSerous carcinomaBiologyMedicineCancerPathologyImmunohistochemistryInternal medicineGynecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: The most common histotype representing 90% of ovarian cancer cases is High Grade Serous Carcinoma. In a previous publication we found C/EBP-δ to be significantly increased in fallopian tube epithelial in BRCA1 mutation carriers and specifically in the luteal phase of the menstrual cycle, by transcription and protein expression. C/EBP-δ represents a master regulator of gene transcription primarily through STAT3 activation in many tumor types. C/EBP-δ is commonly induced by stress and is associated with increased DNA damage. Additionally, studies in breast cancer showed that C/EBP-δ could interact with FANCD2, which is involved in DNA repair along with BRCA1 and BRCA2. C/EBP-δ plays a dichotomous role in tumor suppression and promotion, which is tissue specific. We therefore studied the 1) differential expression of C/EBP-δ in serous carcinoma 2) expression of C/EBP-δ in precursor lesions (STIC) and 3) modeled the effect of over-expression of C/EBP-δ in an in vitro fallopian tube cell culture model. Methods: The study protocol for collection of tissue and clinical information for all patients was approved by the UHN REB. Tissue microarrays containing the different histotypes were used to validate immunohistochemical protein expression. Fallopian tubes with lesions classified as STIC using published diagnostic criteria, were selected (n=15) from women undergoing surgery for HGSC. FTE Cells were propagated on collagen IV coated plates in MCDB105/M199 media supplemented with BPE, EGF, insulin and hydrocortisone. Cells were immortalized via double infection with a lentiviral dominant negative TP53 vector and retroviruses with E7 and hTERT. Statistical analysis was performed using ANOVA (p<0.05) and Fisher’s Exact Test p<0.05). Results/Conclusion: C/EBP-δ is down-regulated in over 60% of HGSC analyzed, an observation which is also histotype specific as LGSC tumors show high expression levels (p<0.01). 60% of C/EBP-δ protein expression exhibited a gradual decrease from the normal FTE to the p53-signatures and the STICs and lost in concomitant HGSC. This indicates an inverse correlation between C/EBP-δ and proliferative index. This suggests that C/EBP-δ regulates cell-cycle progression in the FTE possibly through the G2/M checkpoint and is a potential tumor suppressor in HGSC. In short-term cultures of FTE cell lines, over-expression of C/EBP-δ did not affect proliferation but may affect long-term growth. High expression of C/EBP-δ in FTE cells correlated with decreased vimentin, N-cadherin, ACTA2 and Zeb2 while and in Twist1 and mir21 expression. This data is consistent with the phenotypic effect observed by over-expressing C/EBP-δ in cell culture and indicates an involvement of C/EBP-δ in mesenchymal-to-epithelial transition during high-grade serous carcinogenesis. Citation Format: Sophia HL George, Ramlogan Sowamber, Patricia Shaw. The role of BRCA and CEBPD in serous ovarian cancer carcinogenesis [abstract]. In: Proceedings of the 10th Biennial Ovarian Cancer Research Symposium; Sep 8-9, 2014; Seattle, WA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2015;21(16 Suppl):Abstract nr POSTER-BIOL-1312.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,097

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,283
Tête enseignante GPT0,513
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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