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Enregistrement W2564659355 · doi:10.1128/jvi.02115-16

Autographa californica Multiple Nucleopolyhedrovirus AC83 is a<i>Per Os</i>Infectivity Factor (PIF) Protein Required for Occlusion-Derived Virus (ODV) and Budded Virus Nucleocapsid Assembly as well as Assembly of the PIF Complex in ODV Envelopes

2016· article· en· W2564659355 sur OpenAlexafffund
Muhammad Afzal Javed, Siddhartha Biswas, Leslie G. Willis, Stephanie Harris, Caitlin Pritchard, Monique M. van Oers, B. Cameron Donly, Martin A. Erlandson, Dwayne D. Hegedus, David A. Theilmann

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésBiologyAutographa californicaVirologyInfectivityVirusGeneGeneticsRecombinant DNASpodoptera

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Baculovirus occlusion-derived virus (ODV) initiates infection of lepidopteran larval hosts by binding to the midgut epithelia, which is mediated by per os infectivity factors (PIFs). Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) encodes seven PIF proteins, of which PIF1 to PIF4 form a core complex in ODV envelopes to which PIF0 and PIF6 loosely associate. Deletion of any pif gene results in ODV being unable to bind or enter midgut cells. AC83 also associates with the PIF complex, and this study further analyzed its role in oral infectivity to determine if it is a PIF protein. It had been proposed that AC83 possesses a chitin binding domain that enables transit through the peritrophic matrix; however, no chitin binding activity has ever been demonstrated. AC83 has been reported to be found only in the ODV envelopes, but in contrast, the Orgyia pseudotsugata MNPV AC83 homolog is associated with both ODV nucleocapsids and envelopes. In addition, unlike known pif genes, deletion of ac83 eliminates nucleocapsid formation. We propose a new model for AC83 function and show AC83 is associated with both ODV nucleocapsids and envelopes. We also further define the domain required for nucleocapsid assembly. The cysteine-rich region of AC83 is also shown not to be a chitin binding domain but a zinc finger domain required for the recruitment or assembly of the PIF complex to ODV envelopes. As such, AC83 has all the properties of a PIF protein and should be considered PIF8. In addition, pif7 ( ac110 ) is reported as the 38th baculovirus core gene. IMPORTANCE ODV is essential for the per os infectivity of the baculovirus AcMNPV. To initiate infection, ODV binds to microvilli of lepidopteran midgut cells, a process which requires a group of seven virion envelope proteins called PIFs. In this study, we reexamined the function of AC83, a protein that copurifies with the ODV PIFs, to determine its role in the oral infection process. A zinc finger domain was identified and a new model for AC83 function was proposed. In contrast to previous studies, AC83 was found to be physically located in both the envelope and nucleocapsid of ODV. By deletion analysis, the AC83 domain required for nucleocapsid assembly was more finely delineated. We show that AC83 is required for PIF complex formation and conclude that it is a true per os infectivity factor and should be called PIF8.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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