Epidemiology of the Emergence of Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae in South-Central Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) are an increasing threat. Here, we describe the CPE epidemiology in Southern Ontario, Canada. Methods. We analyzed Toronto Invasive Bacterial Diseases Network (TIBDN) population-based surveillance data from first isolates in October 2007 to April 2016. Patients diagnosed after January 2013 were asked to participate in a prospective cohort, where they were asked for healthcare visits/travel abroad. Results. We identified 270 CPE patients with a median age of 70 years (Table). The incidence increased from 0 in 2006 to 1.1/100 000 in 2015. The most frequent species and enzyme were Klebsiella pneumoniae and New Delhi metallo-β-lactamase (NDM). Incidence and distribution varied significantly in adjacent urban areas (Figures 1 and 2). Of 103 (38%) patients with a CPE infection, 74 (72%) had urinary tract infection, and 24 (23%) blood stream infection. Overall in-hospital mortality was 16%. Among 77 prospectively enrolled patients, healthcare in the Indian subcontinent 1 year prior to CPE identification was reported by 26 of 45 (58%) patients with NDM compared to 4 of 32 (13%) with non-NDM CPE (P < 0.001). Among patients with non-NDM CPE, 18 of 32 (56%) reported no healthcare abroad or travel to the Indian subcontinent (Figure 3). Conclusion. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae are increasing in Southern Ontario. Incidence and risk factors differ clearly by geography. A majority of patients with non-NDM CPE appear to have acquired their CPE in a Canadian hospital. Characteristics of Patients Colonized/Infected With Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae. Numbers Are n (%) If Not Stated Otherwise Disclosures. J. Powis, GSK: Investigator, Research support; S. Poutanen, Merck: Board Member, Honoraria and Speaker honorarium. Paladin Labs: Board Member, Honoraria. Accelerate Diagnostics: Board Member, Honoraria
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».