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Enregistrement W2565087697 · doi:10.1161/atvb.32.suppl_1.a164

Abstract 164: The Chaperone Holdase Bag6 Modulates the Intracellular Fate of Newly Synthesized ApoB100

2012· article· en· W2565087697 sur OpenAlexaff
Eric A. Fisher, Roger S. McLeod

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene knockdownEndoplasmic-reticulum-associated protein degradationApolipoprotein BEndoplasmic reticulumProteasomeVery low-density lipoproteinSecretionCell biologyProtein degradationChemistryChaperone (clinical)CytosolUbiquitinBiochemistryBiologyUnfolded protein responseLipoproteinCholesterolEnzymeApoptosisGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Apolipoprotein B-100 (apoB) is the central protein component of very low density lipoproteins (VLDL) and is subject to endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD). Hepatic assembly of VLDL particles is monitored by the cellular quality control machinery, which determines whether a properly formed lipoprotein is secreted or the inadequately lipidated apoB protein is degraded. Changes in lipid supply, ER folding capacity or ERAD pathway function can alter VLDL output from HepG2 cells. Bag6 is a cytosolic protein that has a role in the bilayer integration of proteins and is also implicated in maintaining the solubility of proteasome substrates that contain exposed hydrophobic regions. Notably, Bag6 has been observed to interact with the ERAD components gp78 and p97, which are known to facilitate apoB degradation. The goal of this study was to evaluate the role of cytosolic Bag6 in apoB metabolism in HepG2 cells. When MG132 was used to inhibit proteasomal degradation of apoB, Bag6 was co-immunoprecipitated with apoB as determined by functional proteomics and immunoblot analysis. Conversely, if VLDL assembly was enhanced by treatment of the cells with the MEK/ERK inhibitor U0126, both the Bag6-apoB and p97-apoB associations were no longer detectable. Metabolic labelling studies indicated that siRNA knockdown of Bag6 did not alter the initial rate of apoB biosynthesis, but decreased the secretion of newly synthesized apoB. The decrease in apoB secretion with Bag6 knockdown could not be reversed by U0126. In addition, Bag6 knockdown decreased the effectiveness of MG132 as an inhibitor of cellular apoB degradation even though ubiquitination of apoB appeared to be unaffected. These observations suggest that Bag6 may be a component of the ERAD pathway that modulates VLDL assembly. Reduction of Bag6 partially decreases both secretion and MG132-inhibitable degradation of apoB, suggesting that another mechanism is also involved in apoB degradation. We hypothesize that the “holdase” function of Bag6 may temporarily stabilize exposed hydrophobic domains of apoB prior to its progression to assembly or degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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