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Enregistrement W2565995632 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-2086

Abstract 2086: Role of the transcription factor NFE2L3 in TNFα signaling pathway in colorectal cancer

2015· article· en· W2565995632 sur OpenAlexaff
Marina Bury, Volker Blank

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerTranscription factorCancerCarcinogenesisCancer researchTumor necrosis factor alphaMedicineBiologyCytokineImmunologyInternal medicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Patients with inflammatory bowel disease have an increased risk of developing colorectal cancer (CRC), which is the third leading cause of cancer related deaths in the world. Our laboratory is studying the transcription factor NFE2L3 [nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 3]. NFE2L3, a member of the Cap’n’Collar family, is a basic-region leucine zipper transcription factor that was identified 15 years ago. Contrary to its extensively studied homolog NFE2L2, the role of NFE2L3 in cancer is still unknown. We demonstrated that NFE2L3 functions as heterodimer by complexing with small Maf (musculoaponeurotic fibrosarcoma) proteins for DNA binding. According to the clinical databases, NFE2L3 is up-regulated in CRC compared to normal tissues. Using the colorimetric MTT viability assay, we determined the optimal concentration to treat colon cell lines with the tumor necrosis factor-alpha (TNFα), a pro-inflammatory cytokine associated with CRC tumorigenesis. We showed that protein levels of NFE2L3 and small Maf proteins are up-regulated by TNFα in CRC cells. We used genomic approaches for identifying genes that are modulated by NFE2L3 after TNFα treatments. The identification of the precise role of NFE2L3 in TNFα signaling pathway will lead to a better understanding of colorectal cancers and will help in the design of novel treatment options. Citation Format: Marina Bury, Volker Blank. Role of the transcription factor NFE2L3 in TNFα signaling pathway in colorectal cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 2086. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-2086

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,426

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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