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Enregistrement W2566502464 · doi:10.1073/pnas.1609569114

Clarifying intact 3D tissues on a microfluidic chip for high-throughput structural analysis

2016· article· en· W2566502464 sur OpenAlexafffund
Yih Yang Chen, Pamuditha N. Silva, Abdullah M. Syed, Shrey Sindhwani, Jonathan V. Rocheleau, Warren C. W. Chan

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésMicroscale chemistryMicrofluidicsMicrofluidic chipThroughputNanotechnologyOrgan-on-a-chipChipRegenerative medicineComputer scienceMaterials scienceCell biologyBiologyStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

On-chip imaging of intact three-dimensional tissues within microfluidic devices is fundamentally hindered by intratissue optical scattering, which impedes their use as tissue models for high-throughput screening assays. Here, we engineered a microfluidic system that preserves and converts tissues into optically transparent structures in less than 1 d, which is 20× faster than current passive clearing approaches. Accelerated clearing was achieved because the microfluidic system enhanced the exchange of interstitial fluids by 567-fold, which increased the rate of removal of optically scattering lipid molecules from the cross-linked tissue. Our enhanced clearing process allowed us to fluorescently image and map the segregation and compartmentalization of different cells during the formation of tumor spheroids, and to track the degradation of vasculature over time within extracted murine pancreatic islets in static culture, which may have implications on the efficacy of beta-cell transplantation treatments for type 1 diabetes. We further developed an image analysis algorithm that automates the analysis of the vasculature connectivity, volume, and cellular spatial distribution of the intact tissue. Our technique allows whole tissue analysis in microfluidic systems, and has implications in the development of organ-on-a-chip systems, high-throughput drug screening devices, and in regenerative medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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