The IDH2 R172K mutation associated with angioimmunoblastic T-cell lymphoma produces 2HG in T cells and impacts lymphoid development
Notice bibliographique
Résumé
Oncogenic isocitrate dehydrogenase (IDH)1 and IDH2 mutations at three hotspot arginine residues cause an enzymatic gain of function that leads to the production and accumulation of the metabolite 2-hydroxyglutarate (2HG), which contributes to the development of a number of malignancies. In the hematopoietic system, mutations in IDH1 at arginine (R) 132 and in IDH2 at R140 and R172 are commonly observed in acute myeloid leukemia, and elevated 2HG is observed in cells and serum. However, in angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL), mutations are almost exclusively restricted to IDH2 R172, and levels of 2HG have not been comprehensively measured. In this study, we investigate the expression pattern of mutant IDH2 in the AITL tumor microenvironment and measure levels of 2HG in tissue and serum of AITL patients. We find that mutant IDH2 expression is restricted to the malignant T-cell component of AITL, and that 2HG is elevated in tumor tissue and serum of patients. We also investigate the differences between the three hotspot mutation sites in IDH1 and IDH2 using conditional knock-in mouse models. These studies show that in the lymphoid system, mutations in IDH2 at R172 produce high levels of 2HG compared with mutations at the other two sites and that lymphoid development is impaired in these animals. These data provide evidence that IDH2 R172 mutations may be the only variants present in AITL because of their capacity to produce significant amounts of the oncometabolite 2HG in the cell of origin of this disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».