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Enregistrement W2566694113 · doi:10.1136/bmjopen-2016-012040

How to measure the impacts of antibiotic resistance and antibiotic development on empiric therapy: new composite indices

2016· article· en· W2566694113 sur OpenAlexafffundabout
Josie Hughes, Amy Hurford, Rita Finley, David M. Patrick, Andrew M. Morris

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkMount Sinai HospitalMemorial University of NewfoundlandPublic Health Agency of CanadaUniversity of British ColumbiaBC Centre for Disease ControlYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineAntibiotic therapyAntibiotic resistanceAntibioticsMeasure (data warehouse)Intensive care medicineEmpiric therapyMicrobiologyAlternative medicineData miningPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: We aimed to construct widely useable summary measures of the net impact of antibiotic resistance on empiric therapy. Summary measures are needed to communicate the importance of resistance, plan and evaluate interventions, and direct policy and investment. DESIGN, SETTING AND PARTICIPANTS: As an example, we retrospectively summarised the 2011 cumulative antibiogram from a Toronto academic intensive care unit. OUTCOME MEASURES: We developed two complementary indices to summarise the clinical impact of antibiotic resistance and drug availability on empiric therapy. The Empiric Coverage Index (ECI) measures susceptibility of common bacterial infections to available empiric antibiotics as a percentage. The Empiric Options Index (EOI) varies from 0 to 'the number of treatment options available', and measures the empiric value of the current stock of antibiotics as a depletable resource. The indices account for drug availability and the relative clinical importance of pathogens. We demonstrate meaning and use by examining the potential impact of new drugs and threatening bacterial strains. CONCLUSIONS: In our intensive care unit coverage of device-associated infections measured by the ECI remains high (98%), but 37-44% of treatment potential measured by the EOI has been lost. Without reserved drugs, the ECI is 86-88%. New cephalosporin/β-lactamase inhibitor combinations could increase the EOI, but no single drug can compensate for losses. Increasing methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) prevalence would have little overall impact (ECI=98%, EOI=4.8-5.2) because many Gram-positives are already resistant to β-lactams. Aminoglycoside resistance, however, could have substantial clinical impact because they are among the few drugs that provide coverage of Gram-negative infections (ECI=97%, EOI=3.8-4.5). Our proposed indices summarise the local impact of antibiotic resistance on empiric coverage (ECI) and available empiric treatment options (EOI) using readily available data. Policymakers and drug developers can use the indices to help evaluate and prioritise initiatives in the effort against antimicrobial resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,334
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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