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Enregistrement W2566712365 · doi:10.1038/srep39087

The biosynthetic pathway of 2-azahypoxanthine in fairy-ring forming fungus

2016· article· en· W2566712365 sur OpenAlexfundno aff
Tomohiro Suzuki, Naoki Yamamoto, Jae‐Hoon Choi, Tomoyuki Takano, Yohei Sasaki, Yurika Terashima, Akinobu Ito, Hideo Dohra, Hirofumi Hirai, Yukino Nakamura, Kentaro Yano, Hirokazu Kawagishi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsShizuoka UniversityMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyMeiji University
Mots-clésAdenine phosphoribosyltransferaseFungusMetaboliteBiochemistryGeneBiologyBiosynthesisMyceliumEnzymePurineBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

"Fairy rings" resulting from fungus-stimulated plant growth occur all over the world. In 2010, 2-azahypoxanthine (AHX) from a fungus Lepista sordida was identified as the "fairy" that stimulates plant growth. Furthermore, 2-aza-8-oxohypoxanthine (AOH) was isolated as a common metabolite of AHX in plants, and the endogenous existence of AHX and AOH in plants was proved. The structure of AHX allowed us to hypothesize that AHX was derived from 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide (AICAR). Thus, we performed a feeding experiment that supplied AICAR to L. sordida. Consumption of AICAR and accumulation of AHX were observed after feeding. The mycelia extract had enzymatic activity of adenine/5-aminoimidazole-4-carboxamide phosphoribosyltransferase (APRT). APRT gene of L. sordida revealed its structural characteristics in homology modeling and showed transcriptional enhancement after feeding. These results support that AHX was synthesized from AICAR and AHX biosynthesis was transcriptionally controlled by AICAR, indicating the presence of novel purine metabolic pathway in L. sordida.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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