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Enregistrement W2566801472 · doi:10.1117/1.jbo.21.12.126008

Low-cost multimodal light sheet microscopy for optically cleared tissues and living specimens

2016· article· en· W2566801472 sur OpenAlexafffund
Vincent Rouger, Ricardo Alchini, Alexei Kazarine, Angelica A. Gopal, Marie‐Pier Girouard, Alyson E. Fournier, Paul W. Wiseman

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomedical Optics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésClearanceMicroscopyLight sheet fluorescence microscopyOptical microscopeMaterials scienceOpticsOptical imagingBiomedical engineeringMedicineScanning confocal electron microscopyScanning electron microscopePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Light sheet microscopy techniques have expanded with designs to address many new applications. Due to rapid advancements in computing power, camera/detector technologies, and tissue clearing techniques, light sheet methods are becoming increasingly popular for biomedical imaging applications at the cellular and tissue levels. Light sheet imaging modalities couple rapid imaging rates, low-levels of phototoxicity, and excellent signal to noise ratios, contributing to their popularity for experimental biology. However, the current major limitation of light sheet microscopy arises from optical aberrations, with the main drawback being the defocusing introduced by refractive index variations that accompany clearing techniques. Here, we propose an inexpensive and easy to build light sheet based instrumentation to overcome this limitation by optomechanically decoupling the sample scanning movement from the detection step. Our solution is relatively simple to implement and also provides increased modularity by using a swappable excitation arm. This expands the range of samples we can image on a single system, from high resolution for single cells at ? m spatial resolution, to tissues with mm spatial resolution. We demonstrate our approach, using the system to image iDISCO cleared embryos and sciatic nerves, and provide the full three-dimensional reconstruction of these objects in minutes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,473

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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