Measuring and predicting the influence of traits on the assembly processes of wood‐inhabiting fungi
Notice bibliographique
Résumé
Summary The identification of traits that influence the responses of the species to environmental variation provides a mechanistic perspective on the assembly processes of ecological communities. While much research linking functional ecology with assembly processes has been conducted with animals and plants, the development of predictive or even conceptual frameworks for fungal functional community ecology remains poorly explored. Particularly, little is known about the contribution of traits to the occurrences of fungal species under different environmental conditions. Wood‐inhabiting fungi are known to strongly respond to habitat disturbance, and thus provide an interesting case study for investigating to what extent variation in occurrence patterns of fungi can be related to traits. We apply a trait‐based joint species distribution model to a data set consisting of fruit‐body occurrence data on 321 wood‐inhabiting fungal species collected in 22 460 dead wood units from managed and natural forest sites. Our results show that environmental filtering plays a big role on shaping wood‐inhabiting fungal communities, as different environments held different communities in terms of species and trait compositions. Most importantly, forest management selected against species with large and long‐lived fruit‐bodies as well as late decayers, and promoted the occurrences of species with small fruit‐bodies and early decayers. A strong phylogenetic signal in the data suggested the existence of also some other functionally important traits than the ones we considered. We found that those species groups that were more prevalent in natural conditions had more associations to other species than species groups that were tolerant to or benefitted from forest management. Therefore, the changes that forest management causes on wood‐inhabiting fungal communities influence ecosystem functioning through simplification of interactive associations among the fungal species. Synthesis. Our results show that functional traits are linked to the responses of wood‐inhabiting fungi to variation in their environment, and thus environmental changes alter ecosystem functions via promoting or reducing species with different fruit‐body types. However, further research is needed to identify other functional traits and to provide conclusive evidence for the adaptive nature of the links from traits to occurrence patterns found here.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».