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Enregistrement W2567275189 · doi:10.1155/2016/5215086

Nile Red and 2-NBDG Are Incompatible for the Simultaneous Detection of Lipid and Glucose Accumulation

2016· article· en· W2567275189 sur OpenAlexafffund
Andrew M. Hogan, Viswanathan Swaminathan, Nikitha K. Pallegar, Sherri L. Christian

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Spectroscopy · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMemorial University of NewfoundlandBeatrice Hunter Cancer Research InstituteResearch and Development Corporation of Newfoundland and LabradorCancer Research Institute
Mots-clésNile redFluorescenceFluorophoreLipid metabolismChemistryBiophysicsLipid dropletBiochemistryBiologyOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glucose is the universal energy source and a critical substrate for lipid synthesis in mammalian cells. Analysis of both glucose and lipid in cells is important for the understanding of the regulation of lipid synthesis in many cell types, but especially adipocytes, the major storage cell for fat in mammals. The fluorescent 7-nitrobenz-2-oxa-1,3-diazole (NBD) derivative of glucose, 2-NBDG, is used to monitor glucose uptake and the lipid-selective fluorophore Nile red is used to monitor lipid accumulation. Previous reports have used NBD-based fluorophores and Nile red simultaneously despite the possibility of spectral overlap. In this study, we determined if these fluorophores were experimentally compatible in preadipocytes and adipocytes stained with 2-NBDG and Nile red separately or costained. We found that Nile red is detectable in the wavelengths necessary to excite and detect 2-NBDG. This interference was further increased by the solvatochromic effect of lipid-localized Nile red. In addition, we found a synergistic increase in fluorescent intensity when both fluorophores were present. Unfortunately, even fine control of the excitation or emission wavelengths did not identify wavelengths suitable for selective detection when cells were costained. Therefore, 2-NBDG and Nile red cannot be used simultaneously—but can likely be used sequentially—to assess glucose uptake and lipid accumulation in lipid-laden cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,150

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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