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Enregistrement W2567342528 · doi:10.1109/iros.2016.7759366

Cleavage-stage embryo rotation tracking and automated micropipette control: Towards automated single cell manipulation

2016· article· en· W2567342528 sur OpenAlexaff
Christopher Yee Wong, James K. Mills

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Bio-sensing Technologies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlastomereAutomationArtificial intelligenceComputer visionComputer scienceRotation (mathematics)PipetteEmbryoSegmentationZona pellucidaPosition (finance)Biomedical engineeringBiologyEngineeringEmbryogenesisOocyteChemistryCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Micromanipulation of individual biological cells, such as embryos during preimplantation genetic diagnosis (PGD), is a delicate and time-consuming task. Two major procedures in PGD include the rotation of the embryo to gain a more favorable position for zona breaching, and the extraction of a blastomere after an opening has been made in the zona pellucida. Rotation tracking of cleavage-stage embryos has not been reported given their lack of distinctive features. In this manuscript, a geometric model for partially determining the three dimensional (3-D) angular position of 2-cell embryos using two dimensional (2-D) microscopic brightfield images was derived and verified using a computer generated model. This model was then applied using computer vision algorithms on a rotating cleavage-stage mouse embryo, demonstrating partial 3-D rotation tracking. Furthermore, embryo micromanipulation tasks are typically performed manually using micropipettes. Technological advances have made automation of these tasks possible. This manuscript also presents computer vision algorithms for the segmentation and calibration of micropipettes. The calibration procedure allowed automated position control of the micropipettes without the need for real-time vision feedback using micropipette recognition algorithms, and effective position control was verified using semi-automated blastomere extraction experiments. This manuscript presents preliminary work towards the automation of cell manipulation procedures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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