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Enregistrement W2568060814 · doi:10.3389/fmars.2016.00275

Microbial Community Structure and Interannual Change in the Last Epishelf Lake Ecosystem in the North Polar Region

2017· article· en· W2568060814 sur OpenAlexafffundabout
Mary Thaler, Warwick F. Vincent, Marie Lionard, Andrew K. Hamilton, Connie Lovejoy

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsArcticNetFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesParks CanadaFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesAssociation of Canadian Universities for Northern Studies
Mots-clésHaloclineThaumarchaeotaWater columnArchaeaOceanographyEcologyBenthic zoneCommunity structureDominance (genetics)PhytoplanktonBiologyFjordStratification (seeds)Microbial population biologyEnvironmental scienceGeologySalinityBacteriaNutrientBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Climate warming is proceeding rapidly in the polar regions, posing a threat to ice-dependent ecosystems. Among the most vulnerable are microbial-dominated epishelf lakes, in which surface ice-damming of an embayment causes a freshwater layer to overlie the sea, creating an interface between distinct habitats. We characterized the physicochemical and biotic environment of Milne Fiord epishelf lake (82° N, Canada) in three successive summers (2010–2012), and on one date of profiling (5 July 2011) we collected samples for high through-put amplicon sequencing of variable regions of small subunit rRNA to characterize the microbial community (Eukarya, Bacteria and Archaea). Potentially active water column communities were investigated using reverse-transcribed rRNA, and phytoplankton were further characterized by accessory pigment analysis. Cluster analysis of pigment data showed a demarcation between freshwater and marine communities, which was also evident in the sequence data. The halocline community of Eukarya was more similar to the deeper marine sample than to the freshwater surface community, while the Archaea and Bacteria communities at this interface clustered more with surface communities. In 2012, conductivity-depth profiles indicated shallowing of the freshwater layer and mixing across the halocline, accompanied by lower picocyanobacteria and higher picoeukaryote concentrations. Picocyanobacteria cells were more evenly distributed throughout the water column in 2012, implying partial deep mixing. Several mixotrophic taxa of Eukarya were more abundant in the freshwater layer, where low nutrient concentrations may favor this lifestyle. Unusual features of Milne Fiord microbial communities included benthic taxa not previously reported in marine water columns (notably, the archaeon Halobacteriales), and dominance by taxa that are typically present in sparse concentrations elsewhere; for example, the Chlorophyte group Radicarteria and the betaproteobacterium Rhodoferax. Milne Fiord epishelf lake is the last known lake of this kind remaining in the Arctic, and the fate of this distinct microbial ecosystem may ultimately depend on the stability of the Milne Fiord ice shelf, which has experienced a negative mass balance over the past half century.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,599
Score d'incertitude au seuil0,925

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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