HPV DNA in saliva from patients with SCC of the head and neck is specific for p16-positive oropharyngeal tumours
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV) is an important cause of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC), especially in young people. These tumours overexpress p16 and respond well to treatment. The rapid detection of HPV in patients with HNSCC may expedite treatment when p16 status is not immediately available. METHODS: Saliva-based DNA collection kits and nested polymerase chain reaction (PCR) were used to determine the HPV status of 62 individuals with biopsy-proven HNSCC. Immunohistochemistry was used to determine tumour p16 status. RESULTS: A total of 62 patients were included in the study. Twenty-nine samples (47%) were positive for HPV DNA, the majority of which were high risk (HR) subtypes (79%). Patients who tested positive for HR HPV were more likely to have a tumour arising in the oropharynx compared to a non-oropharyngeal site (74 vs 26%; p = 0.003). A positive HR HPV saliva assay was 100% specific (95% CI 59-100%) and had a 100% positive predictive value (95% CI 75-100%) for a p16 positive tumour arising in the oropharynx. In contrast, a negative HR HPV assay had a 96% negative predictive value (95% CI 80-100%) for tumours arising in a non-oropharyngeal site. Independent of site, the saliva assay had a sensitivity of 77% (95% CI 54-91%) and a specificity of 94% (95% CI 77-99%), respectively, for a p16 positive tumour. CONCLUSION: We show that a saliva based assay is an effective method for detecting HPV in patients with HNSCC and that a positive HR HPV test is highly specific for p16 positive tumours arising in the oropharynx. This simple and rapid test could be used in cases where a biopsy of the primary tumour is not readily available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».