Phylogenetic analyses of combined morphological and molecular data sets on the Aphanocalyx-Bikinia_tetraberlinia group (Leguminosae, Caesalpinoideae, Detarieae s.l.)
Notice bibliographique
Résumé
Three molecular and one morphological data sets of a group of African tree genera (Leguminosae, Detarieae s.l.) are combined in simultaneous phylogenetic analyses.A few taxa with long branches show an unstable placement, while several other clades remain intact in all analyses.In the genus Aphanocalyx two separate copies of ITS appear to be present.We provide a coding method to circumvent the problems this gives for combining data.Our study strongly supports the monophyly of Aphanocalyx subg.Aphanocalyx, with subg.Antherodontus as its most probable sister group.Bikinia and Tetraberlinia together form a monophyletic group.Bikinia is most likely also a monophyletic group, probably sister to Tetraberlinia, but possibly arising from within it.The internal and terminal branches of this group are relatively short, indicating this group may have radiated fairly recently.Julbernardia is probably monophyletic, and may be sister to Bikinia and Tetraberlinia.The position of the monotypic genus Icuria is still not clear.In the molecular phylogenies this taxon has a long branch with an unstable position.Icuria either has a long separate history or it originates from an anomalous event such as hybridisation.We found strong support for a clade containing Brachystegia, Aphanocalyx, Bikinia, Icuria, Julbernardia and Tetraberlinia.Wieringa, J.J. & Gervais, G.Y.F.(2003).Phylogenetic analyses of combined morphological and molecular data sets on the Aphanocalyx-Bikinia-Tetraberlinia group (Leguminosae, Caesalpinioideae, Detarieae s.l.).In: B.B.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».