Lineage Specification of Pluripotent Populations in Murine Development
Notice bibliographique
Résumé
“The scientist, by the very nature of his commitment, creates more and more questions, never fewer. Indeed the measure of our intellectual maturity, one philosopher suggests, is our capacity to feel less and less satisfied with our answers to better problems.” \n~G.W. Allport, Becoming, 1955 \n\n\tIt will be interesting to look back at this thesis in a few decades and reflect on how the questions and interpretation of data in the field of developmental biology have changed. Indeed, a biologist currently in their twilight years might reflect on their youth, before the discovery of hereditary material, and compare that bookend with the range of genome sequences and related knowledge currently available. How long will it take before this thesis reads like a debate about whether the male or female contributed the ‘homunculus,’ a miniature preformed human to the embryo that grows into an adult?\n\tIn this thesis I asked three related questions: whether the role of Oct4 during embryogenesis provides insight into its contribution to pluripotency; how surfaceome changes contribute to functional maturation of neural stem cells and to what extent the murine genome is imprinted. Our data indicate that Oct4 is required for posterior expansion. We propose that the function of the protein is conserved, but that its expression has been coopted to yield different cell types based on its combination with different factors. We show that fundamental aspects of cell biology are altered during the maturation from pluripotent populations to neural stem cells, and identify mediators of proliferation, survival and adhesion that distinguish neural stem cell regulation from their precursors. Finally, we validated discovery of a dozen novel imprinted transcripts using a genomic approach. These discoveries will contribute to a holistic view of the causes and consequences of imprinting, but do not support a paradigm shift in the scale and consequences of imprinting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».