MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2570375830 · doi:10.1371/journal.pone.0168011

Early Prediction of Alzheimer’s Disease Using Null Longitudinal Model-Based Classifiers

2017· article· en· W2570375830 sur OpenAlexfundno aff
Giovana Gavidia‐Bovadilla, Samir Kanaan-Izquierdo, María Mataró, Alexandre Perera-Lluna

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingSecretaría de Estado de Investigación, Desarrollo e InnovaciónInstituto de Salud Carlos IIINational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SServierEisaiGenentechIXICOBristol-Myers SquibbMinisterio de Economía y CompetitividadGeneralitat de CatalunyaNorthern California Institute for Research and EducationDoD Alzheimer's Disease Neuroimaging InitiativePfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésNull (SQL)DiseaseNull modelAlzheimer's diseaseArtificial intelligenceBiologyMedicineBioinformaticsComputer scienceInternal medicineData miningEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Incipient Alzheimer's Disease (AD) is characterized by a slow onset of clinical symptoms, with pathological brain changes starting several years earlier. Consequently, it is necessary to first understand and differentiate age-related changes in brain regions in the absence of disease, and then to support early and accurate AD diagnosis. However, there is poor understanding of the initial stage of AD; seemingly healthy elderly brains lose matter in regions related to AD, but similar changes can also be found in non-demented subjects having mild cognitive impairment (MCI). By using a Linear Mixed Effects approach, we modelled the change of 166 Magnetic Resonance Imaging (MRI)-based biomarkers available at a 5-year follow up on healthy elderly control (HC, n = 46) subjects. We hypothesized that, by identifying their significant variant (vr) and quasi-variant (qvr) brain regions over time, it would be possible to obtain an age-based null model, which would characterize their normal atrophy and growth patterns as well as the correlation between these two regions. By using the null model on those subjects who had been clinically diagnosed as HC (n = 161), MCI (n = 209) and AD (n = 331), normal age-related changes were estimated and deviation scores (residuals) from the observed MRI-based biomarkers were computed. Subject classification, as well as the early prediction of conversion to MCI and AD, were addressed through residual-based Support Vector Machines (SVM) modelling. We found reductions in most cortical volumes and thicknesses (with evident gender differences) as well as in sub-cortical regions, including greater atrophy in the hippocampus. The average accuracies (ACC) recorded for men and women were: AD-HC: 94.11%, MCI-HC: 83.77% and MCI converted to AD (cAD)-MCI non-converter (sMCI): 76.72%. Likewise, as compared to standard clinical diagnosis methods, SVM classifiers predicted the conversion of cAD to be 1.9 years earlier for females (ACC:72.5%) and 1.4 years earlier for males (ACC:69.0%).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,073

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,209
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,135 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONE→Même sujetDementia and Cognitive Impairment Research→Travaux en français237 207→